人肺腺癌蛋白质组学研究

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肺癌是目前全世界最为常见的恶性肿瘤之一,作为威胁全世界人类健康的重大疾病,其发病率占所有新发现癌症患者的12.6%,死亡率占癌症死亡总数的17.8%,且呈逐渐上升趋势。根据WHO估计二十一世纪我国将成为肺癌发病率较高的国家之一。肺癌依据其组织病理学可分为两大类:小细胞肺癌和非小细胞肺癌。非小细胞肺癌又包含鳞状细胞癌、腺癌、大细胞癌等。其中,腺癌近年来的发病率有不断上升的趋势。肺腺癌作为肺癌发病的常见类型,其发生发展是一个多因素、多基因及多途径改变的复杂过程,虽然从基因和转录水平已对其进行了许多成功的研究,但其癌变机制仍不十分明确,尚缺乏有效的用于肺腺癌早期诊断和预后监测的生物分子标志物,若能直接从蛋白质组入手来研究肺腺癌将可更全面、真实地揭示肺腺癌变的本质,为肺癌的发病及其防治研究开辟新的思路、提供新的线索。本研究以人肺腺癌组织和配对癌旁正常肺组织为研究材料,采用比较蛋白质组学技术筛选肺腺癌相关蛋白质并采用免疫组化技术对发现的差异表达蛋白质进行验证。(一)对20例人肺腺癌组织和配对癌旁正常肺组织进行比较蛋白质组学研究。首先,提取人肺腺癌组织和配对癌旁正常肺组织的总蛋白,经2D Quant One试剂盒准确定量后,利用固相pH梯度双向凝胶电泳技术分离人肺腺癌组织和癌旁正常肺组织的总蛋白质,考马斯亮蓝显色后经图像分析软件识别差异表达蛋白质,应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱和四极杆-飞行时间串联质谱仪鉴定差异表达的蛋白质点。结果如下:(1)以24cm固相pH梯度胶条(pH 3-10)进行人肺腺癌组织和配对癌旁正常肺组织总蛋白的分离,得到了分辨率较高、重复性较好的人肺腺癌组织和癌旁正常肺组织双向凝胶电泳图谱。人肺腺癌组织和癌旁正常配对肺组织各3块凝胶的平均蛋白质点数分别为1052±48和1037±57,同一癌组织3块不同双向电泳凝胶之间蛋白质点在等电聚焦方向的偏差是0.814±0.103,在SDS-PAGE方向上的偏差为1.052±0.185;(2)用PDQUEST分析软件对20例肺腺癌组织及癌旁配对正常肺组织的双向凝胶电泳图谱进行了分析,平均匹配的点数为1006±54,共找到表达差异两倍以上的蛋白质斑点28个;(3)分别应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪和四极杆-飞行时间串联质谱仪对这28个差异蛋白质点进行准确鉴定,共鉴定出20个非冗余蛋白质,上调蛋白质13个、下调蛋白质7个,其中一些为与细胞信号通路,细胞代谢酶类等有关的肺腺癌相关蛋白质。(二)为了验证蛋白质鉴定结果的可靠性,采用免疫组织化学技术对3个肺腺癌相关蛋白(14-3-3Sigma蛋白、膜联蛋白1和锰超氧化物岐化酶)在肺腺癌、肺腺癌转移淋巴结、正常肺组织和肺炎性假瘤中的差异表达情况进行了验证。结果显示14-3-3Sigma蛋白、膜联蛋白1和锰超氧化物岐化酶在人肺腺癌组织和肺腺癌转移淋巴结中的表达明显高于在正常肺组织以及炎性假瘤中的表达,P<0.05,这表明免疫组织化学的分析结果与蛋白质组的分析鉴定结果一致。本研究采用比较蛋白质组技术系统地对肺腺癌组织进行了研究,通过对肺腺癌组织、配对的癌旁正常肺组织的蛋白表达谱进行比较,在国内首次进行人肺腺癌的差异表达蛋白质组学研究,对肺腺癌组织中总蛋白质的抽提方法和上样量进行了摸索,确定了重复性较好的实验方法,并成功鉴定出20个非冗余的与肺腺癌相关的蛋白质;采用免疫组织化学技术对14-3-3Sigma蛋白、膜联蛋白1和锰超氧化物歧化酶在肺腺癌、肺腺癌所致的转移淋巴结、正常肺组织和肺炎性假瘤中的表达情况进行了验证,结果表明这三种蛋白质在肺腺癌、转移淋巴结的表达明显高于在正常组织、炎性假瘤中的表达。这些结果为进一步筛选用于肺腺癌诊断、治疗和预后评估的肺腺癌分子标志物以及肺腺癌发病机制研究奠定了坚实的基础。
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