北沙参,为伞形科植物珊蝴菜（Glehnia littoralis Fr.Schmidt ex Miq.）的干燥根,是我国常用的药食同源植物之一。其含有丰富的营养成分和活性物质,深受消费者的喜爱和认可。近年来,随着药理学更深入的研究,北沙参消费市场不断增长,但各种北沙参掺假现象也随之产生。目前,市场上可见的北沙参混伪品有南沙参、云木香、轮叶党参、川党参、麦瓶草等。这些药材与北沙参性状相似,但功效却有所不同,不能混用。北沙参的掺伪现象严重影响了北沙参产品质量的稳定性和安全性,侵犯了消费者的权益。传统的北沙参基原鉴定方法受人为、环境等因素的影响,不足以应对市场变化的要求。因此亟需开发一种更为快捷可靠的北沙参及其加工产品植物来源的鉴定方法。本研究以北沙参及5种常见混伪品（南沙参、云木香、轮叶党参、川党参、麦瓶草）为研究对象,使用DNA分子标记的方法,在核糖体ITS基因序列、叶绿体trnL-F基因序列中开发出北沙参以及混伪品的单核苷酸多态性（SNP）分子标记。在此基础上,分别设计了北沙参及其混伪品的物种特异性引物,并建立了多重PCR体系实现了北沙参与混伪品的分子区分。所构建的多重PCR体系能检测出北沙参样品中0.1%的混伪品的掺入,检测限低至0.01 ng。且基于叶绿体trnL-F基因序列建立的多重PCR体系可成功应用于北沙参提取物产品以及蒙药“扫日劳清肺止咳胶囊”的来源鉴别。实验结果如下:1.分别以核糖体ITS基因及叶绿体trnL-F基因序列为目的基因,设计通用引物对北沙参以及5种混伪品（南沙参、云木香、轮叶党参、川党参、麦瓶草）的核糖体ITS基因及叶绿体trnL-F基因序列进行扩增,扩增产物均产生单一条带。2.在对北沙参以及5种混伪品（南沙参、云木香、轮叶党参、川党参、麦瓶草）的核糖体ITS基因的扩增序列多重比对后发现,在第766、767和768位碱基上,北沙参为“CCT”,而南沙参为“TGC”、云木香为“TCG”、轮叶党参为“ACG”、川党参为“GCG”、麦瓶草为“GCG”,具备两个碱基的差异性,此差异性可对北沙参进行鉴别;第155位碱基上北沙参为“T”,5种混伪品均为A,第432位碱基上北沙参为“A”,5种混伪品均为“G”,根据这两个位置的碱基差异性,可设计引物对5种混伪品进行鉴别。此外,在对北沙参以及5种混伪品（南沙参、云木香、轮叶党参、川党参、麦瓶草）的叶绿体trnL-F基因的扩增序列多重比对后发现,在第654位碱基上,北沙参为“G”,5种混伪品均为“T”,第880位碱基上北沙参为“C”,5种混伪品均为“T”,根据这两个位置的碱基差异性,可对北沙参进行鉴别;第1081位碱基上,北沙参为“G”,5种混伪品均为“A”,再人为引入一个错配碱基,将1083位碱基G改为T,根据这两个碱基的差异性,可设计引物对5种混伪品进行鉴别。3.根据核糖体ITS基因序列中北沙参以及5种混伪品（南沙参、云木香、轮叶党参、川党参、麦瓶草）的特异性SNP位点,设计了引物bs F3、bs R1和as F、as R,并建立多重PCR体系。在此扩增体系中,北沙参扩增出长度为187 bp的特异性条带,而5种混伪品则都能扩增出长度为295 bp的特异性条带。此外,根据叶绿体trnL-F基因序列中北沙参以及5种混伪品（南沙参、云木香、轮叶党参、川党参、麦瓶草）的特异性SNP位点,设计了引物btF、btR和ntF、ntR2,并建立多重PCR体系。在此扩增体系中,北沙参扩增出长度为210 bp的特异性条带,而5种混伪品则都能扩增出长度为125 bp的特异性条带。4.在北沙参的DNA中掺入不同浓度的混伪品DNA进行检测限分析,最终确定所构建的多重PCR体系能检测出北沙参样品中0.1%的混伪品的掺入,检测限低至0.01 ng。5.将在叶绿体trnL-F基因中构建的多重PCR体系,应用于北沙参和南沙参的提取物产品及含有北沙参成分的蒙药“扫日劳清肺止咳胶囊”的北沙参基原鉴别,北沙参提取物扩增出长度为210 bp的特异性条带,南沙参提取物扩增出长度为125 bp的特异性条带,蒙药“扫日劳清肺止咳胶囊”扩增出长度为210 bp的特异性条带。因此本方法可以准确实现北沙参提取物及深加工产品的植物来源鉴定。本研究开发了一种准确可靠且灵敏度高的北沙参及其产品植物来源DNA分子标记检测方法,可在同一反应中同时区分北沙参及其5种常见混伪品,为北沙参及其产品质量的稳定性和安全性提供了新的DNA分子标记方法,也为其它药食同源植物及其产品的基原鉴别提供了借鉴。