研发投入是企业技术创新的源泉和动力，对于制药行业而言更为重要。对制药业进行研发投入的研究有助于为企业决策者提供决策参考，为提升企业绩效提供决策依据。　　本文在阐述了研发投入、技术创新等相关理论基础上，对近年来国内外研究现状进行分析。目前，制药行业的研发投入、技术创新与企业绩效的研究主要存在以下问题:(1)样本企业不足、统计数据时间跨度短;(2)仅以制药行业的研发投入、技术创新以及企业绩效进行相关性研究，并没有研究企业中研发投入是如何进行，投入到哪些方面以及研发投入与绩效指标产出的效率问题。　　为了解决上述问题本文首先扩大研究样本企业数量并增加了研究的年限，在此基础上将实证研究和案例分析相结合。具体研究内容如下:　　(1)实证研究:本文以我国沪深上市的197家制药企业作为研究对象，统计2008年-2015年企业的研发投入费用、专利数量、净利润等其他本文所需要的研究变量。以研发投入费用作为研发投入的衡量指标;以专利数量作为技术创新的衡量指标;以净利润等作为企业绩效指标。结果表明:制药行业研发投入费用与选取的技术创新指标专利数量具有显著的正相关关系，研发投入费用仅与企业绩效指标净利润呈显著正相关。　　(2)案例研究:在实证分析的基础上，本文选取哈药股份进行案例研究，以技术创新指标的专利数量和企业绩效指标的净利润为主要研究变量。主要从以下两方面研究:一方面对实证研究结果进行验证;另一方面研究了哈药股份研发费用具体投入到哪些方面，如何投入以及研发投入后产出的效率等问题。结果表明:哈药股份研发投入主要集中在生物类产品中，研发投入产出的技术创新效率最高的是用于乙肝药物研究的S001GR项目，研发投入产出的企业绩效效率最高的营养补充剂类。最后，根据本文的研究结果，从宏观的制药行业方面以及具体的哈药股份公司两个角度对研发投入提出一系列建议。