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棉属二倍体A基因组有草棉(A1)和亚洲棉(A2)两个棉种,都属于栽培种,其中A1基因组还有阿非利加棉(A1-a)野生类型,是二倍体野生棉中唯一的有纤维的类型,可能是研究棉花纤维发生和棉属演化的重要资源,因此对阿非利加棉的研究具有重要理论意义和应用价值。本研究成功获得了阿非利加棉与亚洲棉的种间杂交材料,并进一步获得了F2:3、F2:3宿生及F3:4家系群体。本研究借助简化基因组测序技术,对阿非利加棉重要生物性状如苞叶角度、叶柄茸毛、株型等相关QTL进行定位研究。主要结果如下:通过对阿非利加棉lz的生育期及形态进行调查,明确了阿非利加棉的生物学特性。阿非利加棉播种后4-6 d出苗,出苗后29-30 d现蕾,现蕾后27-31 d开花,开花后52-56 d吐絮。从现蕾期至吐絮期,阿非利加棉的苞叶逐渐张开直至平展,苞叶角度不断增大至180°。植株各部位均有密集短茸毛分布,叶柄及主茎有少量长茸毛分布,倒三叶叶柄上长茸毛的数量最少。植株第一果枝节位为9-10台。棉铃为近圆形,多年宿生后有多且细弱分支,各部位均有色素腺体分布。不同世代群体中对苞叶角度、叶柄长茸毛数量及株型进行调查。发现苞叶角度与叶柄茸毛数量为偏态分布;第一果枝节位、第一果枝节位高度、果枝数和株高符合正态分布。随着繁殖世代的增加,各性状的变异系数逐渐降低。F2:3世代形态性状间均呈极显著正相关,F3:4世代株高与第一果枝节位、第一果枝节位高度与果枝数间呈显著正相关,其余性状之间呈极显著正相关。为构建阿非利加棉高密度遗传图谱,对阿非利加棉lz、滇亚10号(亚洲棉地方品系)两个亲本及264个F2单株进行简化基因组测序。遗传图谱共9400个标记,覆盖A基因组所有的13条染色体。图谱总长2035.83 cM,标记间平均距离0.22 cM。A04染色体最长,为177.58 cM;A10染色体最短,为131.2 cM。A12染色体上大于10 cM的gap最多,共计8个;A09染色体上大于10 cM的gap最少,仅有1个。通过与已测序的物理图谱比较分析,发现该遗传图谱与物理图谱具有较高的共线性。使用QTL locimapping 4.2软件对苞叶角度、叶柄茸毛、铃长、铃宽、铃长宽比、株高、果枝数、第一果枝节位、第一果枝节位高度、果枝数等性状进行QTL定位。初步定位到铃长、铃宽、铃长宽比等3个与铃型相关QTL 5个;定位到苞叶角度相关QTL 2个;定位到株高、果枝数、第一果枝节位、第一果枝节位高等4个株型相关QTL 26个;定位到叶柄茸毛数量相关的QTL 6个。