在线磁共振图像重建研究

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磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging,MRI)能够通过不同的成像序列与参数,提供关于人体组织结构与功能的多种信息,且无辐射伤害,是最重要的临床医学影像方法之一。MRI之所以能够提供不同的、丰富的信息,是因为MRI可以使用多种脉冲序列与参数组合进行成像,对应的,不同的成像序列采集的数据也要求使用包含不同的图像重建、后处理及可视化方法的数据流水线进行处理。对上述流水线中的算法进行研究的通常的做法,就是从MRI系统中拷贝原始数据(Raw Data),然后离线进行研究。本文对在线MRI图像重建及后处理进行了研究,即在磁共振成像系统进行扫描的过程中,实时地将采集的原始数据从MRI系统传输到外部个人电脑(PC)中,在外部实时进行图像重建,并将重建后的图像传送回MRI系统。实时在线重建,一方面使得实时成像等应用,如磁共振电影成为可能;另一方面,也可以利用部分采集的数据和重建的图像获得最优的数据采集条件,反馈到MRI系统中,优化数据的采集过程。本文利用TCP/IP网络,在西门子的系统上实现了磁共振图像的实时在线重建,主要包括以下内容:(1)基于自主开发的YAP重建框架研发了MRI扫描仿真程序和重建服务器程序,用软件方式模拟了实时在线磁共振图像重建,帮助算法研究者在离线情况下,也能以模拟的方式进行实时重建算法的研究;(2)开发了基于西门子ICE框架的具有数据通信功能的数据处理程序,和基于YAP框架的外部重建服务器程序,实现了将西门子内建流水线中的数据传输到外部计算机上并进行在线图像重建,最后将重建后的图像传输回MRI系统。这种实时在线重建的方法,更有利于算法研究人员将更多不同的MRI重建算法集成到现有的商业MRI系统中,进行算法的推广与应用等。
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