基于BERT方法的医学文本命名实体识别

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命名实体识别是指识别出一段文本中具有人名、地名、专有名词等特定含义的实体。中文命名实体识别任务是自然语言领域的基础任务,是许多上游任务的基石,而医学文本是中文命名实体识别的一个非常重要的领域。本文就医学文本命名实体识别中存在的嵌套实体识别难的问题提出了一些有效的解决方案。对于命名实体识别,业界通常采用序列标注的方法来识别实体。对于非嵌套实体这样做是方便且有效的,但是对于嵌套实体而言,会出现一些问题,比如难以选择有效的数据标注方法、模型训练复杂度变高、模型预测效果差等问题。于是本文受问答系统的数据集构造和问题预测的启发将问答系统中的方法迁移到命名实体识别领域,通过预测实体的开头、结尾位置以及配对关系来识别相应的实体类型及实体边界。本文提出的BERT-SDOI-SAN-MRC-MRC模型在BERT-MRC模型的基础上,嵌入了能够从冗长医学文本中忽略噪音而能提取到有效信息的SDOI-SAN(基于句法依存关系的自我注意力网络)模块,使得模型能够学习到更深层次的句法和语义信息,除此之外,在MRC模块中对匹配规则作了进一步优化。由实验结果可知,本文提出的模型在损失部分训练速度的情况下对嵌套实体和非嵌套实体的识别能力得到了进一步提高。除了模型构造层面的尝试,本文还在BERT模型的掩码方法和NSP任务去留上做了一些有益的尝试;用基于动态规划的长文本分割方法代替模型输入的切割长文本方法以更好地适应模型输入,最大化保留句子信息和实体不断裂;通过在BERT输出中整合字音字形信息来扩充语义信息;通过修改损失函数来减少数据不平衡带来的不利影响,这些方法对最终的实验结果都有一定的促进作用。综上所述,本文基于BERT方法对医学文本的嵌套实体问题尝试了多种方案,相比业界常用的基准模型,本文提出的BERT-SDOI-SAN-MRC-MRC模型在精确匹配的精确率、召回率和F1值上提升巨大,相较基准模型在F1值上提升了9.3%。
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