LncRNAs组合预测肠菌类型和大肠癌中morn3/penguin调控p53的研究

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背景:特定的肠菌组成模式可能与不同的人类疾病发生相关,如IBD,结直肠癌等。之前的研究表明lncRNAs在大肠癌的发生发展中也起着重要作用。大肠癌中肠道微生物与lncRNA之间的相互作用具体并不清楚。这里展示的是利用一种模型来研究长非编码RNA(lncRNA)表达和肠道微生物之间的联系。在大多数人类肿瘤中,肿瘤抑制基因p53经常处于失活状态,重新激活野生型p53将可能是一种有前途的治疗策略。方法:通过重新注释外显子芯片和比较无菌的、常见和植入特定菌群的小鼠lncRNA表达谱,利用缩小质心的方法,获得基于lncRNAs组合的预测模型来鉴别不同类型的小鼠。通过转染方式检测morn3(penguin)检测对大肠癌细胞凋亡、增殖等功能的影响。Western,co IP等实验探究morn3(penguin)对p53的调控机制。体内实验构建人源性morn3(penguin)转基因小鼠模型和裸鼠移植瘤模型研究morn3(penguin)对p53表达的影响。结果:我们发现每种特定的条件下都含有其丰富特有的lncRNAs表达谱。lncRNA的预测模型很成功地三种不同类型的小鼠,也可以区分出接种了普通小鼠粪便或者斑马鱼粪便的小鼠。体外实验表明在CRC细胞中敲低penguin后促进细胞凋亡与抑制增殖,而且过表达morn3(penguin)后可促进mdm2与p53直接相互作用而泛素化降解p53。人源性转基因小鼠模型和裸鼠移植瘤模型表明morn3(penguin)可以降低p53与p21表达。结论:这些结果提示了肠菌相关的lncRNAs有可能作为一种生物标记物,在宿主-微生物相互作用的过程中识别出有功能的lncRNAs。作为可能的治疗靶点,靶向morn3(penguin)将可能重新激活CRC中野生型p53的功能。
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