基于卷积神经网络的染色体异常检测

来源 :湖南师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chenjason886
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
染色体作为遗传物质的载体,当其表型出现异常时,会导致基因的异常表达。因此,对染色体图像进行核型分析就成为细胞遗传学研究的重要课题之一,对人类遗传学疾病的诊断具有重要的实用价值。由于染色体出现异常的位置不固定且难以预测,且无法收集到足够多的负样本进行模型训练或特征提取,因此,对染色体图像的异常检测具有重要的应用价值。本文研究了卷积神经网络的原理和其经典模型结构,针对染色体异常负样本难以收集的问题,提出了一种基于卷积神经网络半监督学习的染色体异常检测算法,通过卷积神经网络对染色体图像进行特征提取,采用自编码器结构对染色体图像进行降维并重构处理,利用生成对抗网络对整个模型进行训练,根据其重构误差预测输入图像是否存在异常,并且对输入染色体图像进行分类。采用真实的染色体数据样本进行实验,仿真结果表明该方法检测染色体异常具有有效性,改进后的模型异常检测的准确率最高可达87.8%,分类准确度可达84.8%。本文的主要工作内容如下:(1)本文以G显带技术制成的染色体图像作为研究对象,对染色体图像进行了预处理,包括图像去噪、图像分割、边缘检测、中轴线的提取与修正延长等步骤;(2)由于染色体的非刚性特质,染色体易出现弯曲现象,需要对其进行拉直,在拉直过程中,对染色体灰度投影时引入了线性插值,提高了拉直效果;(3)为了对模型进行测试,将612张染色体核型分析图制成带有类别标签的染色单体图像,删除其中无法用于训练的图像,共得到26204张染色单体图像;(4)对基于卷积神经网络的异常检测算法进行了改进,在训练时结合正常样本的标签信息,测试时,可以在异常检测的同时预测类别标签,对染色体进行了分类配对,减轻专业核型员的劳动强度。
其他文献
随着工业发展的日趋智能化,工业机器人应用在工业生产制造过程中也将成为主流趋势之一。工业现场经常存在对散乱工件的定位抓取作业,由于散乱工件存在倾斜、堆叠、遮挡等情况
本文介绍了电化学传感器的原理、分类以及应用前景,对碳纳米材料、含钴和含镍纳米材料及其复合材料修饰电极进行了概述。制备了三种修饰电极,基于电极表面钴、镍基纳米结构化
近年来,随着计算机技术的不断发展,智能监控已广泛应用于日常生活中的各个领域。其广泛的应用场景和巨大的应用价值使得行为识别在计算机视觉领域成为了一个热点研究课题,而
张敦仁(1754—1834),字仲篙,号古愈,又作胡臾,时人称为古余先生,山西省阳城县人,是清代中叶著名的汉学家和数学家。曾任南宫、江西、高安、庐陵等县知县,铜鼓、川沙等厅同知,
本文对荧光传感器、以石墨烯量子点(GQDs)和石墨烯量子点衍生物(GQDs derivatives)为探针的荧光分析、Fenton化学及其应用进行了综述。构建了对核黄素(Rf)、氨茶碱(AP)和芦丁(RT)等药物
随着计算机与信息技术的不断发展,医疗信息化改革的不断深入,医疗服务结构的逐渐完善,对医疗设备行业提出更高的要求。怎样建立磁共振设备规范、科学的评价标准和评价体系,是
从A股市场诞生至今,A股经历了数次大幅的上涨和下跌,这些非理性的大幅涨跌很难完全用传统金融理论做出解释,而行为金融理论正是从投资者情绪的角度出发对各类金融异象与非理性行为现象做出了解释,投资者情绪在股票市场的非理性繁荣和恐慌式下跌中无疑起到了推波助澜的作用。本文以上述现象作为切入点,研究了市场投资者情绪对市场指数收益及异质性上市公司股票收益的影响效应,并使用数据挖掘模型对收集到的数据进行建模。首先
游戏是自人类存在即产生的一种先天性活动,游戏存在的意义同样被人们从各个方面进行探索,电子游戏的出现使大众开始接触并探索游戏,游戏中所具有的教育意义也在不断被人们发
管道是运输石油资源的主要手段。近年来,由于管材老化、盗油打孔等导致的管道泄漏事故不断增加,造成了大量的经济损失和人员伤亡。因此,对管道泄漏点进行快速、准确的定位,是
白光发光二极管(white light-emitting diode)简称白光LED,由于能耗低、寿命长、响应快、环境友好等优点被誉为第四代照明光源。其主流实现方式是使用蓝光LED芯片结合黄色YAG