随着蛋白质结构解析技术的不断革命,大量的蛋白质结构数据源源不断的更新涌现。基于疾病相关蛋白结构的设计策略对新药研发的影响重大而深远,应用此策略发现和开发出了很多新药相继获得美国食品和药物管理局(FDA)批准。本研究以疾病相关的蛋白结构为出发点,快速高效的筛选出一批有效针对疾病的药物苗头化合物,从而为疾病的治疗提供方法和线索。我们研究了AutoDock Vina和LeDock两款分子对接的特点,并从中选出了LeDock作为该研究体系的分子对接程序。虚拟筛选的第一步:建库。小分子数据库和靶点库是虚拟筛选的基石,为了保证库的质量,我们选择了ZINC数据库中的类药化合物,并解决了很多现有的问题,最终得到了完整性和准确性较高的小分子库和靶点库。接着,利用建好的数据库,我们进行了正向的虚拟筛选,得到了一个靶向c-MET的海洋化合物,并用生物互作和细胞活性测定的方法进行了活性的确认。其次,我们利用建立的靶点库进行了反向的虚拟筛选,验证了反向寻靶该方法的有效性。最后,我们以当前的热点问题为出发点,进行了非洲猪瘟病毒DNA聚合酶X的虚拟筛选,并有针对性的选择了两个天然产物数据库作为小分子库,最终得到了13个产自中国的天然产物作为饲料来抑制非洲猪瘟。