小黑杨花芽和叶芽糖基化蛋白质组学研究

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:XFJ1988
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
糖基化修饰是一种蛋白质翻译后修饰方式,它影响蛋白质结构、定位和生物活性等。糖基化蛋白质在植物生长发育、受精识别、抗性防御等多种生物学过程中起到作用。一些研究表明植物细胞壁蛋白质存在糖基化修饰,但植物体内大规模糖基化蛋白质分离与鉴定报道甚少。杨树作为一个重要的木本模式植物,本研究开展小黑杨花芽和叶芽的糖基化蛋白质分离与鉴定,得到的主要结果如下所述。通过ConA-WGA-PNA-Jacalin植物凝集素亲和层析,分离小黑杨雄花芽、雌花芽和叶芽3种组织的糖基化蛋白质。运用shotgun总蛋白质的质谱鉴定技术,鉴定分离的糖基化蛋白质,得到小黑杨雄花芽、雌花芽和叶芽糖基化蛋白质数量分别为199、175和166个。比较雄花芽、雌花芽和叶芽被鉴定的蛋白质信息显示:41个蛋白质在雄花芽、雌花芽和叶芽中均被识别,只在雄花芽、雌花芽或叶芽单一组织被识别的蛋白质分别为75、33和47个;综合这3种组织中被分离鉴定的蛋白质,共得到255个不同的蛋白质。蛋白质的功能分类显示,255个糖基化蛋白共分为10个聚类,主要参与细胞壁合成与代谢、氧化还原、蛋白质降解、信号传递、脂类代谢等生物途径。蛋白质数量排名前4的功能聚类依次是细胞壁合成、修饰和碳水化合物代谢(33%)、氧化还原(22%)、蛋白质降解(12%)和信号传递(10%)。我们分离鉴定的糖基化蛋白质功能分类模式,类似于拟南芥细胞壁蛋白质组的功能分类特征,这种吻合初步暗示植物细胞壁蛋白很可能需要被糖基化修饰,并且糖基化修饰可能是细胞壁蛋白正常分子功能所必需的。为了评价分离与鉴定的糖基化蛋白质,运用相关的生物信息软件对255个糖基化蛋白进行N-糖基化位点和信号肽分析。226个糖基化蛋白存在多个N-糖基化位点,占糖基化蛋白组89%。189个糖基化蛋白具有信号肽,占糖基化蛋白组74%。这一分析结果表明,分离与鉴定的小黑杨花芽和叶芽组织糖基化蛋白具有较高的可靠性。蛋白质的亚细胞定位和跨膜结构域的分析显示:83%糖基化蛋白涉及到分泌途径,定位于细胞壁、细胞膜、内质网和液泡的糖基化蛋白数量分别53%、18%、8%和6%,还有15%的糖基化蛋白定位在细胞内其他部位。此外,34%糖基化蛋白具有跨膜结构域。这一结果显示,我们识别的糖基化蛋白主要是植物的细胞壁蛋白。我们的工作是一次较大规模地分离与鉴定木本植物总糖基化蛋白质组,糖基化蛋白质的功能分类、定位分析等信息初步显示杨树细胞壁蛋白普遍存在糖基化修饰。这些数据为今后鉴定植物细胞壁蛋白糖基化修饰的分子作用,提供了重要基础。
其他文献
近年来,我国地方投融资平台公司为国民经济的发展做出了贡献,同时也积累了较大的财务风险。在财务管理方面存在着缺乏自主独立性、偿债主体划分不明确、偿债能力比较薄弱等主
<正>1984年美国洛杉矶世界科幻年会上,日本动画家高桥伸之从身穿戏服的科幻爱好者身上得到灵感,首先创造并使用了Cosplay这一词汇。Cosplay是costume和play两个词汇的合成,是
中国人多地少,耕地资源紧缺,人口增长与环境污染致使耕地资源不断减少。为保护耕地,确保耕地总量动态平衡,笔者提出了在全国范围内实行耕地的异地补偿,具体方式有异地开发、
采用响应面分析法对无花果果醋的培养条件进行优化。在单因素试验的基础上,进行Box-Behnken中心组合设计,应用响应面法对影响无花果果醋发酵的3个因素(转速、温度、接种量)进
自动猫道机是用于实现钻具自动上下钻台的装置,可大大提高劳动效率。为了研究自动猫道机起升钢丝绳的受力特性,提高系统的安全性,根据猫道机的运动特征,建立了简化的力学模型
<正>重大突发事件是媒体实力的试金石。天灾人祸一旦发生,政府关切,民众关注,此时是媒体需要发挥强项显示水平的时刻,但往往也是自身弱点容易露出马脚的时刻。人脉资源、组稿
对滴灌技术进行了详细介绍,阐述了滴灌技术在发展中国家的应用和发展,分析了该技术的适用条件及各国在使用滴灌技术取得的巨大收益,为我国节水灌溉发展提供借鉴。
<正> 一绪论人类爱好酒精饮料有好多原因,其中当然有生理的影响,清澈透明和漂亮的色泽,吸引了人的视觉,优美的风味,尤其是迷人的芳香,吸引人的嗅觉。化学家老早就用古老的分
美声唱法与民族声乐是两种演唱方式截然不同的音乐,因为文化、政治、地域的不同,使得两种音乐从声音、演唱技巧和听歌感觉等方面具有很大的差别。即使在不同的环境和背景下,