“十三五”时期是全面建成小康社会决胜阶段,也是深化事业单位改革,促进科、教、文、卫健康发展的攻坚时期。“十三五”时期是公益性事业单位改革的重大转折期,公益事业的发展面临着机遇和挑战。一方面,国家下达了事业单位综合配套改革方案,为公益一类事业单位发展提供了良好的外部条件。另一方面,公益一类事业单位却面临体制内管理理念和管理技术比较落伍的实际情况。平衡计分卡是一种卓越的绩效管理方法,它从多个维度将组织战略目标渗透到日常的管理工作中,保障了工作的效率和质量。这种管理理念能够激发公益性事业单位活力,促进公益一类事业单位又好又快发展。本文主要针对公益一类事业单位绩效评价体系进行研究,运用理论研究与案例分析相结合的方法,在对绩效管理相关内容和利益相关者理论的研究基础之上,首先,充分分析了公益一类事业单位绩效评价面临的问题,即组织目标不够明确,财务绩效观念比较弱,考核指标不够科学,没有建立完善的沟通机制。接着,对公益一类事业单位选择平衡计分卡绩效评价进行原因分析,认为公益一类事业单位与平衡计分卡价值理念相契合,并且平衡计分卡可以为解决原有绩效评价体系存在的问题提供一个路径。藉此,以K疾控中心为例,分析了K疾控中心现有评价体系的现状,即存在考核指标与发展目标联系不紧密、指标过于单一和不符合实际的问题。为了优化、完善其绩效评价体系,构建了K疾控中心基于平衡计分卡的绩效评价体系。在体系构建过程中,先是结合K疾控中心战略目标制定了中心的组织战略图,再是从服务对象、业务水平、内部流程、财务管理、学习与发展这五个维度选取具体评价指标,并运用层次分析法计算指标权重,然后是设计了绩效评价体系的目标值、计分标准和计分方法。最后,介绍了绩效结果可以应用于哪些方面,并分析了K疾控中心实施平衡计分卡绩效评价体系的保障措施,主要从完善配套改革、科学设置岗位、与薪酬制度相结合来保障平衡计分卡的实施效果。同时提出公益一类事业单位运用平衡计分卡进行绩效评价应注意的问题,一是构建平衡计分卡绩效评价体系需要投入成本,二是平衡计分卡绩效评价指标需要量体裁衣,随着时间的推移不断修正。将平衡计分卡运用于公益一类事业单位组织绩效评价体系是对公益一类事业单位管理理念和管理方法的一次探索。希望通过本文对公益一类事业单位引入平衡计分卡的探讨,以及平衡计分卡在K疾控中心绩效评价体系的应用,能够对其他公益一类事业单位实施平衡计分卡起到参考价值。