微小RNA(microRNA)是一类长度为21-24 nt,在多细胞生物中广泛存在的小分子RNA,在动植物的发育,分化等过程中具有重要的调控作用。其作用方式主要是通过结合mRNA3非翻译区来切割mRNA或者抑制mRNA的翻译。近几年在病毒中发现了许多病毒编码的微小RNA分子,它们帮助病毒逃避宿主免疫系统的攻击或者进入潜伏感染。然而,目前发现的绝大部分病毒编码的微小RNA都来自于DNA病毒,极少有RNA病毒来源的微小RNA的报道,并且对它们在病毒感染以及与宿主间相互作用过程中的功能了解十分有限。本研究中,我们利用计算机预测与实验相结合的手段鉴定了一个新的HIV-1病毒编码的微小RNA基因,miR-H3。该微小RNA在宿主细胞质和细胞核中有相近的表达水平,暗示其可能在细胞核内发生作用。体外过表达该微小RNA可以显著增强假病毒的病毒产量,缺失该微小RNA的野生型HIV病毒在人外周血CD4+淋巴细胞中的复制受到明显的抑制。miR-H3可以显著增强一个HIV-1重要前体蛋白P55的表达,同时在过表达miR-H3的条件下,HIV来源的总转录产物量也明显上升。这种增强作用是对HIV病毒特异的,而在其他相关病毒中没有发现。通过一系列的序列筛选。我们发现miR-H3的作用位点在HIV的5LTR区域,即启动子区域。计算机预测表明在HIV的核心启动子TATA box上存在一个miR-H3非常理想的结合位点。该位点突变后。miR-H3的转录激活作用消失;插入该结合位点,miR-H3可以上调其他病毒启动子的转录水平,表明miR-H3通过与该位点特异性的结合来增强HIV病毒的转录。最近有报道指小RNA可以通过与基因启动子作用来增强基因的表,这一过程往往有AGO2蛋白及基因启动子区域的非编码转录产物参与。本研究中,AGO2蛋白对miR-H3的激活作用没有影响,另外HIV-1启动子区域的非编码转录产物也未被发现。我们推测miR-H3进入了转录起始复合体,并与解链的TATA box DNA相结合,稳定了转录起始复合体的结构,进而促进了转录的起始。