排污权交易市场不但在美国等国家由概念变为现实，而且在全球范围内引起了高度的重视。然而组建排污权交易市场，在理论和实践中首先要解决的一个关键问题是初始排污权分配问题，因为初始排污权分配问题即是组建排污权交易市场的起点和基础，又是排污权交易中争议最大和最困难的问题。 初始排污权的分配方式主要有免费分配和有偿分配（公开拍卖和标价出售）两种。初始排污权的免费分配是基本的分配方式，但采用免费分配方式的难点在于确立分配原则和分配标准。本文从信息经济学、环境经济学等现代经济学的基本思想与方法出发，探讨了初始排污权免费分配的原则，分析了交易成本对初始排污权免费分配的影响，阐述了初始排污权拍卖所应采取的方式，并基于Montgomery理论建立了初始排污权定价的理论模型。在此基础上，本文结合我国经济发展和环境保护的特点，探讨了我国初始排污权的分配方式，并设计了我国初始排污权多级层次分配的模式。 由于初始排污权分配不仅关系到厂商的自身利益，而且关系到经济的可持续发展问题，因此，初始排污权分配中需要研究与解决的问题很多，也很复杂，尤其如何在我国有效地进行初始排污权分配，需要研究和回答的问题就更多了，但愿有更多的学者进行这方面的研究和探讨。