新疆维吾尔自治区是中国陆地面积最大,交界邻国最多,陆地边境线最长的省级行政区,它共有55个民族成份,截止2016年末,总人口共计2398.08万人,其中少数民族约占60%。新疆自治区幅员辽阔,拥有大量的矿产资源、生物、中医药资源、农牧业资源,在经济社会发展中发挥重要作用。自2017年1月,国务院印发了关于“十三五”推进基本公共服务均等化规划以来,全区积极探索讨论研究推进基本公共服务均等化实施细则,2016年底,财政用于民生类公共服务支出占74.7%,自治区以民生优先,财政转移支付是推进基本公共服务均等化的重要手段。完善转移支付制度,是缩小地区差距、促进全地区经济社会协调发展的迫切需要。2014第二次中央新疆工作座谈会召开以来,新疆各地、州、市经济总量不断扩大、社会事业不断发展,但因为财政资金分配和财政转移支付制度还存在部分不合理的地方,各地、州、市间财力仍存在巨大差异。调整财政资源在新疆各地、州、市间横向和纵向的不平衡,逐步实现公共服务均等化,事关新疆各地、州、市的长治久安、民族团结和社会稳定。本文基于新疆自治区财政转移支付制度实践进行分析,分析了新疆自治区内基础教育、公共医疗卫生服务供给情况,以投入类、产出类、效果类三个方面进行区内基本公共服务效果评价,分析出当前新疆自治区财政转移支付总量不足、转移支付结构不合理、资金分配不合理、自治区内上下级政府事权划分不清晰,支出责任不明确四方面问题,借鉴了与我国财政体制类似的日本财力保障制度以及自成体系的加拿大财政转移支付制度的成功经验,得出了实现区内公共服务均等化的财政转移支付的改进建议:即完善财政转移支付制度、扩大新疆地区转移支付规模、优化区内转移支付结构,建立健全转移支付监督机制,调整区内产业结构,增加地方财政收入,合理厘清新疆自治区上下级政府间财权、事权的范围,有效促进自治区内实现基本公共服务均等化,多举并措,为新疆自治区推行基本公共服务均等化提供财力保障。