低温促进裂壶藻DHA积累的分子机制研究

来源 :国家海洋局第三海洋研究所 | 被引量 : 1次 | 上传用户:xuzhonghai01
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二十二碳六烯酸(Docosahexaenoic acid, DHA)是长链多不饱和脂肪酸,对神经系统发育及视力保护至关重要。本研究选取的裂壶藻(Schizochytrium sp. TIO01)具有生长速度快、发酵周期短、高产多不饱和脂肪酸等特点,是目前工业化生产DHA的热门菌种之一。根据已有报道可知低温能显著提高裂壶藻DHA的积累,为了研究参与该生物过程的关键调控蛋白,本论文分别选取30℃对数期(30log)和15℃对数期(15log)的裂壶藻,进行生理生化指标测定、转录组测序、差异表达基因分析及Q-PCR验证等,试图从转录水平上研究低温促进DHA积累的分子机制。具体的研究结果如下:  1)裂壶藻在30℃对数期DHA占总脂肪酸含量的百分比为48.36%,15℃对数期DHA占总脂肪酸含量的百分比则达67.38%;  2)一共测了100.01 Gb数据,组装并去冗余后得到43,550个Unigene,总长度,平均长度,N50以及GC含量分别为54,436,700 bp,1,249 bp,2,526 bp和47.60%;DEG检测结果发现,15log vs30log之间有376个上调基因和50个下调基因;  3)选取10个差异表达基因进行实时荧光定量PCR,其中9个基因差异表达的趋势与转录组结果一致,表明转录组数据准确可信;  4)对差异表达基因进行KEGG富集分析发现与DHA合成相关的脂肪酸代谢通路中,低温条件下FAS途径中脂肪酸合酶及PKS途径中脂肪酸合酶等多个相关基因均表达下调,而下游途径的Δ9脱氢酶、Δ12脱氢酶、Δ9延长酶、Δ8脱氢酶以及Δ4脱氢酶等相关基因则表达上调,推测这些基因在低温积累DHA过程中起着关键作用。同时我们发现与钙调蛋白相关的多个基因表达上调,由于Ca2+-CaM在低温胁迫中发挥着重要的信号转导功能,故我们进一步推测钙调素相关基因在该过程起着调控作用,可在后续试验中敲除该基因并验证其功能。
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