中国亚热带是全球生物多样性热点地区之一,该地区植物谱系格局一直以来都是植物学家们关注的内容。本研究基于全分布区采样和不同遗传标记,系统研究了不同地质和气候变化事件对中国亚热带三种森林植物青钱柳、大血藤和血水草遗传多样性和谱系地理格局的影响。主要研究结果如下:1)青钱柳研究结果显示,该物种现有叶绿体单倍型共祖时间追溯至第三纪,即16.69 Ma(95%HPD 8.42–27.86 Ma),是迄今为止中国亚热带单个物种谱系分化最古老的植物,与中新世全球气候变冷和亚洲季风首次加强时间吻合。其后又出现两次种内分化高峰,分别发生在9.6 Ma和3.6 Ma,与两次亚洲季风加强事件吻合(10–8Ma和3.6–2.6 Ma)。更新世以来,青钱柳至少经历了两次种群扩张,即从1.0 Ma开始的扩张事件和60 Ka的快速扩张。青钱柳遗传分布格局正好符合中国亚热带多个避难所模型和种群扩张模型。2)大血藤第四纪发生了两次强烈的种群扩张事件,一次是在85.98 Ka,与倒数第二个间冰期时间吻合,另一次是在中更新世。而且,根据大血藤叶绿体单倍型的分布格局首次推测了中国亚热带三条植物迁移路线,该结果说明第四纪气候变化对某些亚热带植物分布区影响极为显著,存在典型的冰期收缩—间冰期扩张现象。3)血水草结果显示,第四纪降雨量的变化对其遗传多样性和遗传结构有较大的影响。中国亚热带武夷山脉、罗霄山脉、南岭以及云贵高原东侧,无论是第四纪冰期还是现在,降雨量一直能满足血水草的生长,所以血水草主要分布区并没有长时间隔离,其遗传分化不明显。而西部山地(云贵高原西侧,武陵山和大巴山),末次盛冰期比现在干旱的多,血水草可能难以生存。全新世暖期西边降雨量增加,血水草由东部群体回迁至西部山地。