传染性脾肾坏死病毒和虎纹蛙病毒部分功能基因的分析及表达

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鳜鱼传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)是近年来广东省养殖鳜鱼暴发性传染病的主要病毒性病原.该论文的第一部分在ISKNV全基因组序列测定完成的基础上,发现了ISKNV胞嘧啶5-甲基转移酶(DMet)基因,对其进行序列分析、克隆和体外表达,并对体外表达的DMet进行生物学活性分析.该文应用生物信息学软件,将ISKNV基因组全序列与公共数据库GenBank的基因和蛋白序列进行同源性比较,结果发现ISKNV046LORF含有完整的胞嘧啶5-甲基转移酶(DMet)基因,长684bp,编码277个氨基酸.对ISKNVDMet进行核苷酸序列、氨基酸序列、系统发育进化关系和功能区特征分析,发现感染脊椎动物的虹彩病毒DMet基因均含有高度保守区域,可据此设计引物,采用PCR方法鉴定新分离的脊椎动物虹彩病毒.ISKNVDMet基因含有负责执行转移甲基功能的4个高度保守模体,缺少细菌DMet的识别靶序列的长可变区和IX、X区.该论文还参与了TFV基因组全序列的测定工作,是虹彩病毒科继完成LCDV-1和ISKNV全基因组序列测定以后第3个完成全基因组序列测定的虹彩病毒.应用生物信息学软件对鳜鱼传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)和虎纹蛙病毒(TFV)的解旋酶(helicase)基因进行了序列结构分析,并探讨了该基因的功能结构域.
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