杨树作为木本植物的模式树种,具有重要的经济价值和生态价值。基因重复机制导致植物产生了大量的重复基因,很多重复基因在维持植物正常的形态和生理有重要贡献,通过研究重复基因的特性,可以迅速地从大量基因中找到对非生物胁迫响应的基因。在本研究中,首先从毛果杨基因组鉴定了重复基因,接着分析了不同选择模式下的进化速率、基因特征和非生物胁迫下表达模式,构建了毛果杨基因家族数据库,同时开展了毛果杨VQ基因家族的进化分析及其对盐胁迫的响应。获得以下主要结果:1.获得了34092个负选择基因,1544个正选择基因。2.负选择基因具有更长的基因序列、更多的外显子、更高的GC含量、更高的表达水平、更广泛的表达、更多的GO术语、更高比例的差异表达基因和差异内含子保留基因。3.负选择基因的表达水平和Ka、Ks显示显著负相关,而正选择基因的表达水平则和Ka、Ks、Ka/Ks显示显著正相关。4.构建了毛果杨基因家族数据库GFDP（http://gfdp.ahau-edu.cn/）。该数据库收集了145个毛果杨基因家族和6551个基因,并进行了结构、进化、功能的相关注释以及可视化处理。5.毛果杨VQ基因有51个成员,包含64对重复基因,全基因组重复事件比例最高,占比59.38%。6.具有差异表达基因的重复对,在盐胁迫下的响应表现不对称功能。7.亚细胞定位显示PtVQ1定位于细胞核和细胞膜、PtVQ13定位于细胞核。