不同基因家族密码子使用偏性分析

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该文对不同基因家族密码子的使用偏性进行了研究.由于遗传密码的简并性,在翻译过程中同义密码子的使用概率不同.当前已经发现基因密码子的使用概率与基因的转录、基因的功能、所编码蛋白的结构以及mRNA的翻译有着密切的关系.在该文中,我们建立了密码子使用概率的分析模型,利用MicrosoftVisualC++编程语言编写了计算密码子使用概率的软件系统Gene_ Codon,创建了基固密码子使用概率数据库Codon_ Data.该文用系统聚类分析方法对3种哺乳动物的主要组织相容性复合体(MHC)基国以及人类HLA核酸序列同义密码子使用偏性进行了研究.结果发现,不同物种的MHC基因中相同类型的基因具有相近的同义密码子使用偏性,而对于同一类型的基因由物种引起的同义密码子使用偏性的差异较小.即功能和类型决定密码子使用模式的大的分类,而物种决定该大类中进一步的差异.该文同时对8种功能类型的266条酿酒酵母基因进行方差分析,结果表明,不同功能的基因其密码子使用偏性有着显著的区别.
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