目的：核酸适配子是通过指数富集配体系统进化技术从单链寡核苷酸文库中筛选出的能与靶分子高特异性、高亲和力结合的核酸配体。在前期工作中我们筛选出一批针对肝癌血清特异的核酸适配子。毛细管电泳是一种微量分析技术，具有高效、自动化程度高、快速等优点。本研究旨在建立一种基于毛细管电泳技术的核酸适配子与血清结合程度的分析方法，为适配子在肝癌诊断中的应用提供一种简便有效的新方法。方法：（1）核酸适配子来源及合成：选用本课题组前期工作中以肝癌混合血清为靶标筛选出的诊断价值较好的适配子AP-HCS-9-90，由上海Sangon公司合成，并在5’端标记FAM。（2）血清标本收集：收集南昌大学第一附属医院2010~2012年间确诊的原发性肝癌患者及参加健康体检且各项检查均正常的正常人血清。并制成肝癌混合血清和正常混合血清。（3）毛细管电泳检测适配子的重复性观察：将适配子溶液直接进行毛细管电泳检测，重复检测，观察实验的重复性；将适配子溶液与肝癌混合血清孵育后进行毛细管电泳分析，重复检测，观察实验的重复性。（4）毛细管电泳检测适配子的影响因素分析：将梯度浓度的适配子分别与肝癌混合血清和正常混合血清孵育后进行毛细管电泳，以确定合适的适配子用量；将合适用量的适配子与血清在不同温度下孵育后进行毛细管电泳，以确定合适的孵育温度；将合适用量的适配子与血清在合适温度下孵育后以不同电压进行毛细管电泳，以确定合适的分离电压；将合适的适配子用量与血清在合适温度下孵育后以不同的进样时长进样并以合适的电压进行毛细管电泳，以确定合适的进样时间。最后，在上述合适的条件下，以不同的运行缓冲液进行毛细管电泳，确定合适的缓冲液。（5）毛细管电泳条件正交实验：在初步优化条件基础上，选取影响程度较大的4个参数，分别设置4个水平，设计正交表，将适配子分别与肝癌混合血清、正常混合血清孵育，重复三次实验，确定最佳条件。（6）适配子的诊断价值分析：以最佳的条件进行临床标本检测，对峰面积比值进行受试者工作特征（ROC）曲线，观察曲线下面积（AUC）大小，计算适配子诊断肝癌的敏感度、特异度和准确度等诊断效能指标，以评价其对肝癌的诊断价值。结果：（1）毛细管电泳技术检测的重复性：适配子溶液的进行了10个复管的毛细管电泳分析，变异系数为4.48%；适配子溶液与肝癌混合血清孵育后进行毛细管电泳，10个复管的变异系数为4.93%。（2）毛细管电泳检测适配子的影响因素分析：合适的适配子用量为0.9pmol。合适的孵育温度为25℃，合适的分离电泳为25KV，合适的进样时间为5s，合适的缓冲液为磷酸盐缓冲液。（3）正交实验：肝癌混合血清的C峰面积与B峰面积之比明显大于正常混合血清。以该比值为指标进行统计分析，确定的最佳实验条件为：缓冲液pH8、电压15kV、孵育时间20min、适配子用量0.5μmol/L。（4）对肝癌的诊断价值：以上述优化条件检测了111例肝癌血清标本和61例正常血清标本。肝癌组的C峰面积及C/B峰面积之比值与正常对照组的差异均具有统计学意义（P=0.000），前者的AUC为0.930，诊断肝癌敏感度、特异度和准确度分别为94.6%、80.3%、90.7%，后者的AUC为0.925，诊断肝癌的敏感度、特异度和准确度分别为91.0%、85.2%和89.0%。结论：本研究对毛细管电泳技术分析肝癌血清适配子与血清结合程度的影响因素进行了研究，在单因素分析的基础上进行正交试验优化实验条件，成功建立起基于毛细管电泳的适配子检测应用方法，并在肝癌诊断中具有良好的价值。