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目的:尽管越来越多的证据表明包括组蛋白甲基化在内的表观遗传学异常在胃癌中发挥重要作用,但包括预后分析在内临床研究的缺乏限制了其在胃癌研究中的地位以及在临床的应用。本研究旨在检测四种组蛋白H3赖氨酸位点的三甲基化与胃癌患者进展及预后的关联,并验证其组合表达模式。
方法:(1)购得四张由159例胃腺癌组织制成的组织芯片,以及四张包含其中98例病人对应的癌旁健康组织芯片,并且包含四至六年的随访得到的完整临床基本资料。(2)使用免疫组织化学方法分别对H3K4me3、H3K9me3、H3K27me3和H3K36me3四种H3组蛋白三甲基化在胃腺癌组织和毗邻健康组织中的表达进行检测。(3)用非参数Wilcoxon符号秩检验比较四种蛋白两两之间的表达差异,非参数Wilcoxon符号秩检验也用于比较配对的肿瘤组织和正常组织之间四种蛋白的表达差异,用卡方检验比较高表达组和低表达组之间基线资料指标的差异,作出Kaplan-Meier生存曲线、并采用log-rank检验比较每种蛋白高表达组和低表达组之间总体生存率的差异,建立COX比例风险回归模型进行单因素和多因素分析,以及用斯皮尔曼相关性分析检验四种蛋白表达的相关性。(4)使用Mann-Whitneyu检验检测基因芯片数据库中编码KMT2C(MLL3)、KMT1A(Suv39H1)、EZH2、KDM6A、KMT3A(SETD2)和CDH1(CD324)六种组蛋白H3赖氨酸甲基转移酶、赖氨酸去甲基化酶和相关功能蛋白基因在癌症患者和正常患者之间的差异表达,作出Kaplan-Meier生存曲线并用log-rank检验分析其各自表达量高低与胃癌患者总体生存率的关系。
成果:(1)非参数Wilcoxon符号秩检验表明除了H3K27me3和H3K36me3的表达水平无明显差异(p=0.069)以外,四种H3组蛋白三甲基化表达水平两两之间均有显著统计学差异(p<0.05)。(2)非参数Wilcoxon符号秩检验结果显示H3K4me3(p=0.013)和H3K9me3(p<0.001)在胃腺癌组织和癌旁健康组织中呈现差异性表达,而H3K27me3(p=0.477)和H3K36me3(p=0.120)在胃腺癌组织和癌旁健康组织中的表达无显著统计学差异。(3)卡方检验结果示四种H3组蛋白三甲基化的低表达与胃腺癌患者较好的预后相关(H3K4me3,H3K9me3,H3K27me3,andH3K36me3分别是p=0.004,p=0.005,p=0.037,andp=0.045),H3K9me3、H3K27me3和H3K36me3的高表达与较高TNM中N分期和临床分期呈正相关,值得注意的是,相对于贲门癌H3K4me3在胃体和胃窦癌中表达水平更高(p=0.003)。(4)log-rank检验显示四种H3组蛋白三甲基化的低表达与更好的生存率相关,多因素分析表明H3K4me3(p=0.005),H3K9me3(p=0.003),H3K27me3(p=0.006),和H3K36me3(p=0.026)四种H3组蛋白三甲基化对于总体生存期(OS)而言均为独立的预后因素。(5)斯皮尔曼相关性检验结果示四种H3组蛋白三甲基化表达水平两两之间均呈中等程度相关。(6)KMT2C(MLL3)、KMT1A(Suv39H1)、EZH2、KDM6A、KMT3A(SETD2)和CDH1(CD324)在胃癌与正常患者间呈现出表达差异,且均与胃癌患者总体生存率表现出显著相关性。
结论:在胃腺癌中H3K4me3、H3K9me3、H3K27me3和H3K36me3四种H3组蛋白赖氨酸位点的三甲基化表达水平两两之间呈正相关,提示可能存在潜在组合表达模式;四种组蛋白H3赖氨酸位点三甲基化的低表达与胃腺癌较好的预后相关,且均为独立的预后指标,提示可能作为潜在的肿瘤标志物。
方法:(1)购得四张由159例胃腺癌组织制成的组织芯片,以及四张包含其中98例病人对应的癌旁健康组织芯片,并且包含四至六年的随访得到的完整临床基本资料。(2)使用免疫组织化学方法分别对H3K4me3、H3K9me3、H3K27me3和H3K36me3四种H3组蛋白三甲基化在胃腺癌组织和毗邻健康组织中的表达进行检测。(3)用非参数Wilcoxon符号秩检验比较四种蛋白两两之间的表达差异,非参数Wilcoxon符号秩检验也用于比较配对的肿瘤组织和正常组织之间四种蛋白的表达差异,用卡方检验比较高表达组和低表达组之间基线资料指标的差异,作出Kaplan-Meier生存曲线、并采用log-rank检验比较每种蛋白高表达组和低表达组之间总体生存率的差异,建立COX比例风险回归模型进行单因素和多因素分析,以及用斯皮尔曼相关性分析检验四种蛋白表达的相关性。(4)使用Mann-Whitneyu检验检测基因芯片数据库中编码KMT2C(MLL3)、KMT1A(Suv39H1)、EZH2、KDM6A、KMT3A(SETD2)和CDH1(CD324)六种组蛋白H3赖氨酸甲基转移酶、赖氨酸去甲基化酶和相关功能蛋白基因在癌症患者和正常患者之间的差异表达,作出Kaplan-Meier生存曲线并用log-rank检验分析其各自表达量高低与胃癌患者总体生存率的关系。
成果:(1)非参数Wilcoxon符号秩检验表明除了H3K27me3和H3K36me3的表达水平无明显差异(p=0.069)以外,四种H3组蛋白三甲基化表达水平两两之间均有显著统计学差异(p<0.05)。(2)非参数Wilcoxon符号秩检验结果显示H3K4me3(p=0.013)和H3K9me3(p<0.001)在胃腺癌组织和癌旁健康组织中呈现差异性表达,而H3K27me3(p=0.477)和H3K36me3(p=0.120)在胃腺癌组织和癌旁健康组织中的表达无显著统计学差异。(3)卡方检验结果示四种H3组蛋白三甲基化的低表达与胃腺癌患者较好的预后相关(H3K4me3,H3K9me3,H3K27me3,andH3K36me3分别是p=0.004,p=0.005,p=0.037,andp=0.045),H3K9me3、H3K27me3和H3K36me3的高表达与较高TNM中N分期和临床分期呈正相关,值得注意的是,相对于贲门癌H3K4me3在胃体和胃窦癌中表达水平更高(p=0.003)。(4)log-rank检验显示四种H3组蛋白三甲基化的低表达与更好的生存率相关,多因素分析表明H3K4me3(p=0.005),H3K9me3(p=0.003),H3K27me3(p=0.006),和H3K36me3(p=0.026)四种H3组蛋白三甲基化对于总体生存期(OS)而言均为独立的预后因素。(5)斯皮尔曼相关性检验结果示四种H3组蛋白三甲基化表达水平两两之间均呈中等程度相关。(6)KMT2C(MLL3)、KMT1A(Suv39H1)、EZH2、KDM6A、KMT3A(SETD2)和CDH1(CD324)在胃癌与正常患者间呈现出表达差异,且均与胃癌患者总体生存率表现出显著相关性。
结论:在胃腺癌中H3K4me3、H3K9me3、H3K27me3和H3K36me3四种H3组蛋白赖氨酸位点的三甲基化表达水平两两之间呈正相关,提示可能存在潜在组合表达模式;四种组蛋白H3赖氨酸位点三甲基化的低表达与胃腺癌较好的预后相关,且均为独立的预后指标,提示可能作为潜在的肿瘤标志物。