【摘 要】
:
伴随着单细胞转录组测序技术的进步,我们对细胞的观察能力也在提高。相较于之前只能获取一组细胞基因表达均值的转录组测序技术,新的转录组测序技术能够获得单个细胞的全局基因表达谱。这有助于提高我们对细胞分化以及疾病发病过程的理解。然而,单细胞转录组测序数据具有高维、低密度的特点,使得分析单细胞基因表达谱数据仍然是一项具有挑战性的任务。因此,很多的降维方法被用于单细胞转录组测序数据的降维。但是这些降维算法是
论文部分内容阅读
伴随着单细胞转录组测序技术的进步,我们对细胞的观察能力也在提高。相较于之前只能获取一组细胞基因表达均值的转录组测序技术,新的转录组测序技术能够获得单个细胞的全局基因表达谱。这有助于提高我们对细胞分化以及疾病发病过程的理解。然而,单细胞转录组测序数据具有高维、低密度的特点,使得分析单细胞基因表达谱数据仍然是一项具有挑战性的任务。因此,很多的降维方法被用于单细胞转录组测序数据的降维。但是这些降维算法是从数据自身的角度出发,没有考虑基因在功能上的差别。针对此问题,本文基于基因之间在生物学上的依赖关系,从基因功能的角度对单细胞转录组进行特征选择。本文将具有相同功能的基因作为一个集合,以集合为单位对单细胞转录组数据进行基因筛选。在此基础上,本文提出了一种基因功能组的选取与集成方法,包括单个基因功能组的选取方法和多个基因功能组的选取与集成方法,并使用了6组公开的单细胞转录测序数据和一个功能注释数据在8种降维聚类算法组合上进行结果比对,从而验证基于基因功能进行特征筛选的可行性。本文经过实验发现,功能所含的基因数量以及功能的生物学意义都会对细胞的聚类产生影响。实验结果表明,从单个基因功能进行特征选择后的数据,可以使降维聚类等后续实验具有更好的可解释性。多个基因功能的组合使用,可以使t-SNE和UMAP算法在降维可视化和聚类效果上取得更好的结果。
其他文献
本文以钢琴改编曲《思恋》为主要研究对象,对演奏中的二度创作进行了探究。该作品由但昭义改编自谷建芬创作的声乐曲《那就是我》,表达了作者对恩师的感谢与思念。本文共分为四个章节,第一章介绍了二度创作的含义以及二度创作的真实性、差异性、创造性三个特点。第二章分析了钢琴曲《思恋》的创作特征。第三章从谱面标记与实际演奏的差异性、内在逻辑与感情倾向的统一性以及弹性速度的合理性三个方面来分析了钢琴曲《思恋》的二度
受到中美竞争加剧和国内外疫情肆虐等多重因素的影响下,我国金融行业的竞争日趋激烈。通过实施内部管理机制创新,提升在金融行业的市场竞争力成为一种必然选择。GD银行深圳分行董事会及管理团队清晰地认识到改变当前招标采购粗放式管理的重要性和必要性,并须尽快完善推出招标采购管理的机制创新和改进方案。本研究主要运用了文献阅读法、实证分析法、归纳法等方法。首先从制约GD银行深圳分行招标采购管理发展的招采人员身兼数
随着经济社会的发展,共享经济模式已经悄然成为社会发展的重要组成。信用租赁已成为经济热点和共享经济发展趋势,其发展空间大、利润更加丰厚,其生产和应用将给整个商业社会带来深刻的变革,将给社会带来更多的财富。手机成为了人民日常生活的必备工具,手机信用租赁多采用免押金租赁,手机租赁成为了共享经济的重要组成。本文首先阐述了A公司的手机租赁业务概况、业务流程等,采用文献分析方法、问卷方法、数据分析方法等,分析
本文以研发、专利、注册、制造、市场、服务作为产品价值创造的主线,产品发展策略的目标是创造更大的价值并获得更多的利润。总体思路是以人为本、协同创新、降本增效和与时俱进,也就是说以人才驱动产品发展,在生命周期各阶段持续创造价值;结合公司不同产品线的优势,加强高校和同行的合作和创新;降低产品运营成本和费用,提高人效和品效;密切关注行业动态和外部环境趋势,在新赛道上逐步突破、实现超越。分析了开立医疗彩超产
中国特色社会主义进入新时代,习近平总书记对做好政协提案工作提出一系列重要要求。汪洋多次作出部署,要求进一步抓好提案各环节工作,发挥协商平台作用,提高协商议政质量,推动提案工作全面提质增效。作为参政议政平台之一,人民政协的重要性日渐显著。在政协开展的诸多工作中,各个党派团体、政协委员能够以各种各样的方式履职尽责,而其中,提案工作最能体现其特点,提案办理的质量在影响政协工作实效好坏中的作用毋庸置疑。本
斯坦尼斯拉夫斯基体系中的核心理论——“演员有机天性的下意识创作”的提出与延展在全世界表演艺术领域中的影响是直接的、有效的。他要求演员的内部与外部生活要遵循人的天性的全部规律,通过下意识的手段达到成功塑造角色的目的。演员要有意识地培养和训练自己主动掌握合乎逻辑的有机行动,来达到掌握下意识创作的技巧。本文通过毕业剧目《2021赵氏孤儿大报仇》中“庄姬”这一角色的塑造过程,依托“演员有机天性的下意识创作
党的十九大提出,要加强和创新社会治理。这是当前社会发展规律的要求,也是百姓生活幸福、社会平安稳定、国家稳步发展的重要保障。基层作为社会的基石,在治理过程中要直面群众,事务繁杂艰巨,是社会治理的基础和重心。社区作为基层治理的重点,在当前发展阶段,需要倍受重视。如今,志愿服务蓬勃兴起,在基层治理中,社区志愿者的参与起到了举足轻重的作用。尤其是在2020年爆发的新冠肺炎疫情中,疫情之所以能够得到及时控制
选调生制度从建立以来,一直带有一层神秘的面纱。随着近年来招考政策的不断调整和越来越多的应届毕业生进入选调队伍下派到基层,选调生才逐渐被公众所了解和熟知。但是,与公众认知相背离的是,选调生作为公务员中的“公务员”,在有着提拔政策倾斜的情况下,仍有大量基层选调生选择离职,且这个趋势愈演愈烈,使得基层政府内部面临人才留不住的窘境。同时,选择留在基层的选调生也面临着各种各样的问题,这都是上层政治决策和基层
全球化的不断深入使得世界各国之间的联系日益紧密,互联网的飞速发展让跨境电商等贸易新模式得到迅猛发展,所有这些使得近年来跨国贸易、国际快件和进出境邮递物品的数量急剧增长,给国家海关的高效运行造成了巨大挑战。尤其在2018年机构改革以来,海关监管职责在注重税收风险防控的同时,安全准入风险也被纳入其管理范畴,邮递物品安全准入风险的影响日益加重,濒危物种、毒品、武器弹药等通过邮递渠道变换不同的走私手法频频
目的:探讨我国强迫症(Obsessive-compulsive disorder,OCD)患者的童年创伤与强迫症状、内隐记忆(Implicit Memory,IM)、外显记忆(Explicit Memory,EM)之间的相关性。强迫症是临床常见的精神障碍,会给患者及家庭带来较大的痛苦和负担,目前以药物治疗及认知治疗为主要治疗方法。有研究指出,童年期创伤经历越多,越有可能出现精神病理症状,其中包括强