MMP-9、DNMTs、MeCP2基因多态性及基因间交互作用与精神分裂症关系的研究

来源 :中南大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:zhumengen
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目的(1)研究MMP-9、DNMT1、DNMT3A、DNMT3B基因多态性与精神分裂症的关联性;(2)按照性别分组后,研究X染色体上MeCP2基因多态性与女性精神分裂症的关联性:(3)研究DNMT1、DNMT3A、DNMT3B基因间交互作用与精神分裂症的关联性。方法(1)采用PCR-RFLP方法对符合DSM-Ⅳ诊断标准的精神分裂症患者298例及对照组298例MMP-9基因rs3918242位点进行基因分型,等位基因频率和基因型频率采用χ2检验统计分析,比较病例组和对照组之间的差异。(2)采用基于质谱微阵列技术的基因多态性分析法对符合DSM-Ⅳ诊断标准的487例精神分裂症患者和496例正常对照组中DNMT1、 DNMT3A、DNMT3B上的6个SNP位点进行基因分型,用χ2检验比较上述6个位点的基因型频率和等位基因频率的组间差异。使用在线软件SNPstats对DNMT3A进行连锁不平衡和单体型分析,置换检验对结果进行校正。(3)按照性别对487例患者和496例正常对照进行男女分组,采用基于质谱微阵列技术的基因多态性分析法对女性MeCP2上的5个SNP位点进行基因分型,采用χ2检验统计分析,比较病例组和对照组之间基因型频率的差异;使用在线软件SNPstats对MeCP2基因进行连锁不平衡和单体型分析,置换检验对结果进行校正。(4)多因子降维分析(MDR)用于研究精神分裂症患者DNMT1、 DNMT3A、DNMT3B基因间的交互作用,选择交叉验证一致性最高、检验准确度最大统计结果最有显著性差异的组合作为最佳模型。结果(1)MMP-9基因rs3918242位点SZ组与对照组相比C/C、(C/T+T/T)基因型频率差异有统计学意义(P=0.036),SZ组与对照组相比C、T等位基因频率差异有统计学意义(P=0.046)。(2) DNMT1基因rs2228612位点G/A基因型在对照组比例为42.9%,而在病例组比例为36.2%,统计分析基因型频率差异有显著意义(P=0.031)。(3)DNMT3A基因rs11887120基因型T/T在患者组和对照组中的分布频率统计分析中具有统计学差异(P=0.045);男性人群单体型GTTC分布频率在病例组为0.3037,对照组分布为0.2558,P值为0.0058,两组之间差异有统计学意义。(4)MeCP2基因rs1616369位点G/A基因型分布频率在女性患者组和对照组差异有统计学意义(P=0.031);rs3027933位点G/C基因型分布频率在患者组和对照组之间差异有统计学意义(P=0.034);rs2239464在位点Donimant模型中A/A基因型分布频率在患者组和对照组之间差异有统计学意义(P=0.024);位点rs17435基因型T/A分布频率在两组之间对比有差异性,P值为0.027,有统计学意义;位点rs1734792基因型C/A分布频率在两组之间有显著性差异,P值为0.0083;在Donimant模型中,A/A基因型分布频率在两组之间有显著性差异,P值为0.0035。女性人群的单体型GCCA分布频率在病例组为0.1581,在对照组为0.2389,P值为0.025,两组之间差异有显著性。(5)MDR分析显示,六个位点基因型组合(rs6119954-rs11887120-rs13420827-rs6511685-rs2228612-rs1550117)是精神分裂症DNMTs相关基因间交互作用的最佳模型,其检验准确度为0.4822,交叉验证一致性为10/10,P<0.0001。结论:(1)MMP-9基因C(-1562)T多态位点跟精神分裂症发病相关,MMP-9基因可能是精神分裂症的易感基因之一。(2)DNMT1基因rs2228612位点多态性跟精神分裂症发病相关,DNMT1基因可能是精神分裂症的易感基因之一。(3)DNMT3A基因上的rs11887120位点T/T基因型可能跟精神分裂症发病相关,男性单体型GTTC分布频率在病例组较高,可能是精神分裂症的易感因素。(4)女性MeCP2基因上的rs1616369G/A基因型、rs3027933G/C基因型、rs1734792C/A基因型、rs2239464A/A基因型、rs17435位点T/A基因型可能跟精神分裂发病有相关性,MeCP2基因可能是女性精神分裂症易感基因,女性人群的单体型GCCA分布频率在病例组较低(P=0.025),该单体型可能是精神分裂症的保护因素。(5)经过基因交互作用研究发现,DNMT1、DNMT3A、DNMT3B三基因之间的交互作用跟精神分裂症发病相关,它们之间的交互作用可能会增加精神分裂症的易感性。
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