甜瓜结实花初花节位QTL分析

来源 :东北农业大学 | 被引量 : 7次 | 上传用户:battichen
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甜瓜(Cucumis melo L.;2n = 2x = 24)为葫芦科(Cucurbitaceae)甜瓜属(Cucumis Linn)一年生草本植物,是葫芦科重要的经济作物之一。随着新一代分子标记技术的发展,甜瓜遗传连锁图谱构建工作迅速发展,构建高密度的甜瓜遗传图谱和不断利用新开发的标记构建饱和遗传图谱是目前甜瓜基因组学研究的重要内容之一。由于甜瓜品种间杂交群体构建的连锁图标记数偏少、饱和度差、基因组覆盖率低,所获得QTL数量少,大多数QTL位置不够准确,QTL与标记间的图距偏大,难以满足分子标记辅助选择的需要,特别是关于甜瓜开花相关的QTL更是鲜为报道。为了在分子水平上研究甜瓜结实花开花相关问题,本研究利用分子生物学方法找出与甜瓜结实花初花节位相关基因紧密连锁的SSR标记,研究其遗传关系,分析QTL,为进一步开展相关基因克隆,进而应用分子标记辅助选择技术育出具有优异商品性的甜瓜品种奠定基础。本试验选用由美国威斯康星大学瓜类遗传育种研究室提供的纯雌株厚皮网纹甜瓜品系WI998作为母本,雄全同株厚皮甜瓜品系TopMark作为父本,配置杂交组合,采用单粒传的方式得到171个株系的重组自交系(F2S4)群体,利用SSR分子标记技术构建甜瓜分子标记遗传连锁图谱。通过在亲本间对1219对SSR引物筛选,获得多态性引物163对,多态率13.4%。将163对引物全部进行重组自交系群体分析,构建了一张包含138个SSR标记的分子遗传连锁图谱,该连锁图谱包含19个连锁群,覆盖基因组长度为1414.2cM,标记间平均距离为10.2cM。基于WI998×TopMark群体构建的遗传连锁图谱,结合2010年春季和秋季两季结实花初花节位性状调查结果,利用MapQTL2.0软件对结实花初花节位开展QTL分析,共检测到9个QTL,分别分布在第1、9、10、11连锁群上,各QTL的LOD值在2.89~9.42之间。其中4个QTL贡献率超过10%,位于第9连锁群的QTLFp9.4贡献率最大为18.57%(2010秋季LOD=9.17);位于第9连锁群的Fp9.3(2010春季8.64%,LOD=6.44;2010秋季17.99%,LOD=9.42)位于第10连锁群的Fp10.1(2010春季3.59%,LOD=2.89;2010秋季6.20%,LOD=3.43)在两季的位置都很稳定。各位点加性效应的扫描结果表明,有8个QTL的加性效应为负值,对降低结实花初花节位来说表现为增效加性效应,其中2010年春季检测到位于第9染色体上的QTLFp9.4加性效应最大为-0.32,只有QTLFp10.1加性效应两季均为正值,分别为0.20和0.18,对降低结实花初花节位来说表现为减效加性效应。通过对检测到的9个结实花初花节位QTL分析表明,与结实花初花节位紧密连锁(<10cM)的特异标记8个(SSR01737、MU141991、TJ105、GCM206、SSR04910、MU173563、NR52、MU146331),距离最近的QTLFp 9.3与标记GCM206的连锁距离仅为0.8 cM。为进一步开展QTL精细定位提供参考。
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