水权市场理论的探索是水资源开发、利用、保护、配置中最核心的问题之一是缓解我国用水矛盾、实现水资源优化配置的有效途径。本文从水权交易与农地流转协同运行这一视角切入,通过分析水权交易市场与农地流转市场的内在联系,揭示水权交易市场与农地流转市场相互促进、相互影响的内在机理,为完善水权交易市场、实现水资源的高效配置提供了一种崭新的思路。同时,也对推进农业规模化、高效化经营和农村的经济社会发展意义重大。本文主要立足于民勤县水权交易市场和农地流转市场发展的现实基础和必要条件,以协同理论和调研数据为支撑,测量了民勤县水权交易市场与农地流转市场发展的协同度。最后,基于民勤县水权交易市场与农地流转市场发展过程中的现实障碍,笔者从运行机制、交易机制、监督管理机制以及保障机制四个方面入手,对推进民勤县如何推进水权交易市场与农地流转市场协同运行提出了相关对策建议。