兰科植物在生态系统中具有重要地位,且观赏价值与药用价值极高。菌根真菌对其完成生活史至关重要,研究兰科植物菌根真菌多样性对兰科植物的开发与保护具有重要作用。本研究以中国辽宁省境内的9种兰科植物为例,利用第二代测序技术对其根、根际土和根围土中的真菌群落进行了研究。结果表明:(1)细葶无柱兰(Amitostigma gracile),二叶舌唇兰(Platanthera chlorantha),小斑叶兰(Goodyera bomiensis)和山兰(Oreorchis patens)都偏好于和Ceratobasidiaceae共生,长苞头蕊兰(Cephalanthera longibracteata)能与Thelephoraceae,Ceratobasidium和Sebacinaceae共生;羊耳蒜(Liparis makinoana)偏好与Tulasnellaceae共生;珊瑚兰(Corallorhiza trifida)对菌根真菌具有极高的特异性,只与Thelephoraceae共生;绶草(Spiranthes sinensis)偏好于和丝核菌共生,比如Rhizoctonia和Sebacinaceae。(2)从群落上看,不同生境的同种兰科植物以及同一生境的同种兰科植物根内的菌根真菌群落之间都有着明显差异;同一生境的不同兰科植物之间也有着各不相同的菌根真菌群落;同时,兰科植物根内的菌根真菌群落和土壤中的菌根真菌群落也具有明显差异,在兰科植物根内出现的菌根真菌在土壤中的丰度并不高,甚至没有。(3)我们还对菌根真菌随兰科植物亲缘关系的变化进行了分析,但只发现了亲缘关系较近的绶草和小斑叶兰的菌根真菌之间展现了相近的亲缘关系,在其余植物中没有发现。(4)在本次研究中,除珊瑚兰以外的所有兰科植物根中都存在了大量非菌根真菌,而菌根真菌所占比例都远小于非菌根真菌。