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发酵床垫料中含有大量的微生物,这些微生物能够快速分解粪尿中的有机物,生成气体、菌体物质和其他非蛋白质物质。本试验旨在从微观上为发酵床饲养技术的应用提供依据。利用变性梯度凝胶电泳(Denaturing gradient gel electrophoresis, DGGE)指纹图谱技术研究了不同猪舍的发酵床垫料与粪便的菌群异同,及深圳安远猪舍与南京地区猪、鸡舍发酵床垫料与粪便的菌群差异。试验共分为两个部分。1.猪舍发酵床垫料与粪便中菌群的相似性分析利用基于16S rRNA基因的PCR/DGGE技术对经产母猪舍、产房舍、保育舍和肥育舍的鲜粪样菌群,以及发酵床的不同状态(干燥、潮湿、粪多、粪少)、不同深度(10cm、15cm及30cm)的垫料的菌群进行了研究。结果表明,发酵床垫料中菌群种类丰富,其组成主要受粪便菌群的影响,同源细菌占60%,其中经产母猪舍、产房舍、保育舍和肥育舍分别为53-64%、56-67%、53-64%及57-68%,垫料平均菌群条带数,粪多、潮湿的大于粪少、干燥的(P<0.01)。四类猪舍的粪样与垫料的相似性分别为30%、33%、36%及36%。就不同深度而言,10cm和15cm垫料菌群相似度最高,均大于50%。2.不同来源的发酵床垫料与粪便中菌群的研究利用16S rRNA基因分子方法研究了不同动物种类(鸡和猪)、不同地区(深圳和南京)发酵床垫料与粪便中菌群的分布情况。DGGE图谱分析表明,鸡舍发酵床垫料中来源于粪便的菌群比例为79%,剩余的21%是来自于环境(饲粮、水、土壤等)的外源菌群。不同地区粪样菌群结构相似度低于30%,不同动物发酵床垫料菌群结构相似度为37%。说明不同地区不同动物粪便及垫料的菌群结构均有差异,其中动物种类因素的影响较大。