人组织激肽释放酶家族在结直肠癌中的表达和预后分析

来源 :青岛大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liqingxian1986
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目的:结直肠癌是癌症相关死亡的主要原因之一,是世界范围内的主要公共卫生问题。人体组织激肽释放酶家族(KLK,human kallikrein-related peptidase)的几个成员是新兴的癌症生物标志物,在恶性肿瘤组织中经常观察到KLK基因的表达,不同KLK基因的表达与结直肠癌各种临床病理参数有关。本研究将探讨KLK在结直肠癌中的表达及其对预后的影响。研究方法:挖掘ONCOMINE数据库,对各种类型恶性肿瘤中人KLK基因的表达进行分析。挖掘TCGA数据库,分析人KLK基因在结直肠癌组织和正常结直肠组织中的表达情况,进一步挖掘TCGA数据库以及GSE39582系列数据,分析人KLK基因表达与结直肠癌预后的关系。通过定量逆转录聚合酶链反应分析临床样本中人KLK基因在结直肠癌组织和正常结直肠组织中的表达水平。通过挖掘STRING数据库,对KLK基因相关的蛋白质-蛋白质作用网络进行分析。在细胞水平上进一步验证KLK6、KLK8和KLK10基因对结肠癌细胞的生长和增殖的影响,使用CCK8测试细胞的增殖能力。结果:ONCOMINE数据库中,KLK6、KLK8、KLK10和KLK11基因在结直肠癌组织中具有高水平的表达。GSE39582系列数据中,结直肠癌组织中人KLK6、KLK7、KLK8、KLK10、KLK11和KLK12基因的表达水平均明显高于正常结直肠组织,差异均有统计学意义(P<0.05)。KLK6、KLK8、KLK10和KLK12基因低表达患者的预后分别优于上述基因高表达的患者,差异均有统计学意义(P<0.05)。临床样本中,结直肠癌组织中KLK1基因的表达水平低于正常结直肠组织,KLK6、KLK7、KLK8、KLK10和KLK11基因的表达水平均高于正常结直肠组织,差异均有统计学意义(P<0.05)。通过蛋白质-蛋白质作用网络分析发现,α-突触核蛋白(SNCA)、YY1关联因子2(YAF2)和α2-巨球蛋白样蛋白1(A2ML1)等10个蛋白与KLK6、KLK8和KLK10具有相互作用。在细胞水平上,使用si RNA敲除KLK6、KLK8和KLK10基因都具有较好的敲除效果。CCK8测试了敲除KLK6、KLK8和KLK10基因表达后细胞的增殖能力,结果显示HT-29和SW480的细胞生长和增殖能力受到明显的抑制作用。结论:本研究通过挖掘多个数据库,对临床收集的结直肠癌组织和正常结直肠组织样本中KLK基因检测,通过绘制蛋白质-蛋白质作用网络分析,以及在细胞水平进行实验,结果发现KLK6、KLK8和KLK10基因在结直肠癌组织中高表达,且与结直肠癌患者的预后有关。
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