提高国家科研机构的创新绩效，是提高国家自主创新能力和建设创新型国家的战略需要。开展国家科研机构的创新绩效评价，可以为提高国家科研机构的创新能力提供政策依据。　　 本文提出了一种国家科研机构的创新绩效评价模型。创新绩效模型包括：创新产出、创新投入、创新绩效(包括人均创新产出和单位经费创新产出)的概念模型。测度方法包括：创新产出、创新投入和创新绩效的测度方法。　　 本文对19个国家科研机构过去9年的创新绩效进行了定量评价和统计分析，发现：(1)科研经费投入、科研人员投入与创新绩效的关系比较复杂，有正相关、负相关和相关不显著。(2)国家科研机构的创新活动存在“单位经费创新产出的递减效应”；当人均科研经费投入超过某个临界值时，“单位经费创新产出”将会出现递减。(3)国家科研机构的创新绩效存在较大的学科差异，创新绩效的学科相对差距约为1至3倍。(4)国家科研机构的科研人员结构对创新绩效有较大影响；有些学科的科研机构，高级岗位比例高，创新绩效也高；有些学科的科研机构，高级岗位比例减小，创新绩效反而有所增加；有些学科研究生对创新绩效贡献较大，有些学科作用不太明显。