在知识经济时代,顺应经济全球化和科济全球化的大趋势,跨国公司的研发全球化行为开始向纵深发展。但跨国公司在发展中国家进行研发合作或独立研发仍然是新事物,特别是在中国,跨国公司的研发活动是从上一世纪八、九十年代才开始的。因此,跨国公司在华的研发活动,尤其是跨国公司同中国的大学和科研机构进行大量的研发合作,就是本文所要探讨和研究的问题。本文分析认为,鉴于中国经济和科学技术发展的水平,以及跨国公司自身发展战略的要求,跨国公司在华的研发活动主要集中在同中国的大学或科研机构进行研发合作上,尤其是同中国一些科研实力较强的著名大学进行研发合作。在合作的过程中,除了具体研发项目的合作以外,最成熟的合作方式是跨国公司与中国大学共建研发机构进行全面的R&D合作。本文认为,跨国公司与中国大学进行研发合作活动是有其深刻的内在原因的,首先是跨国公司自身的发展战略所致,而其在根本上是受市场驱动的;但在知识经济时代,这种合作更主要是受知识驱动的。跨国公司之所以同中国大学进行研发合作,关键是跨国公司为了利用中国大学中的知识资源,包括先进的科技水平、完善的科研设备和方式,以及优秀、廉价的中国人才资源。虽然这种合作在形式上是互惠互利的,但它对于中国的国家创新系统建设,对中国的大学和企业以及整个社会经济、科技发展都提出了新的问题和挑战。本文通过理论分析和实证分析,借助于清华大学与跨国公司之间的研发合作案例,论述了跨国公司与中国大学之间的研发合作状况。文章主要以跨国公司与中国大学共建研发机构这一最成熟的合作形式作为重点,运用相关理论分析了跨国公司与中国大学进行研发合作的必然性、合作的方式以及双方合作的动机等,以及这种合作带来的社会效应和它的未来发展趋势等。本文考察了跨国公司与中国大学共建研发机构进行合作过程中面临的诸多问题,提出了一些针对性的建议:进一步开展跨国公司与中国大学的合作,须加强中国大学在合作中的主体地位并加大知识产权的保护力度,规范合作机构、项目的科学管理等。并以此推动中国大学、企业以及创新系统的发展和完善。