近年来,动物源性食品安全事件频发,对经济和生态效益造成严重影响,对人类健康造成严重威胁。我国作为猪肉消费大国,猪肉及其制品的质量、安全和价格备受关注,从食品原料源头上控制和保障其食用安全关乎民生问题。目前,猪源性病原微生物污染趋势明显,戊型肝炎病毒（Hepatitis E virus,HEV）是一种人兽共患病病原,可通过食用受污染的动物肉或其制品导致人类感染,猪流行性腹泻病毒（Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV）和猪δ冠状病毒（Porcine delta corona virus,PDCoV）病原感染给人们日常饮食带来安全隐患和巨大影响,同时导致国际贸易受损。因此,本文建立了一种高灵敏度、高特异性的三重芯片数字PCR（Triple Chip digital PCR,cdPCR）方法,对猪肉及其制品中HEV、PEDV和PDCoV三种病毒实现同时定量检测,保障猪肉食品安全。研究结果如下:1.设计HEV引物探针,PEDV引物探针引用标准SN/T 1699-2017《猪流行性腹泻检疫技术规范》合成,PDCoV引物探针引用标准SN/T 5124-2019《猪Delta冠状病毒检疫技术规范》合成,同时构建阳性质粒,进行退火温度及引物、探针浓度优化,建立单重荧光定量PCR（Quantitative PCR Detecting System,qPCR）和cdPCR检测体系,分别确定其检测范围。结果发现,HEV qPCR和cdPCR检测方法最低检测限分别为3.01 copies/μL、0.660 copies/μL,标准曲线相关系数R~2分别为0.9985、0.9931,单重HEV qPCR检测限是cdPCR的4.56倍;单重PEDV和PDCoV cdPCR检测方法最低检测限分别为0.465 copies/μL、0.353 copies/μL,是其对应qPCR检测方法的1/100和1/20。标准曲线相关系数R~2分别为0.995和0.9951,线性相关性好。几种检测方法特异性好,变异系数（CV%）均小于3%,具有良好的重复性。2.在已建立的单重qPCR和cdPCR方法基础上,建立三重qPCR、cdPCR方法,优化检测HEV、PEDV和PDCoV的体系。结果显示:三重qPCR和cdPCR方法灵敏度较高,前者检测限分别为HEV:6.02 copies/μL、PEDV:6.98 copies/μL、PDCoV:6.92 copies/μL,后者检测限分别为HEV:0.350 copies/μL、PEDV:0.358copies/μL、PDCoV:0.358 copies/μL,是前者的1/20。绘制标准曲线分析,在三重qPCR和cdPCR方法中,HEV相关系数R~2分别为0.9989和0.9986;PEDV相关系数R~2分别为0.9961和0.9949;PDCoV相关系数R~2分别为0.9925和0.9979,检测方法线性相关性好,且检测方法变异系数（CV%）均小于3%,具有良好的特异性和稳定性。3.将建立好的HEV、PEDV和PDCoV三重qPCR方法和三重cdPCR方法应用到实际样品检测中。结果显示,在248份出口猪肉及其制品中三种病毒检出率均为0%,与标准检测结果相符;在282份生猪拭子样品中三种病毒检出率分别为0.35%、1.06%、3.19%,较标准检测方法,HEV检出率提升,PEDV和PDCoV检出率一致。