近年来，医疗纠纷逐年上升，得到了社会的普遍关注。医疗纠纷的妥善处理既涉及到医患双方利益的衡量，也涉及到医疗卫生事业的健康发展和广大人民群众医疗健康的公共利益。医疗损害是医疗纠纷中最典型的一类纠纷，如何妥善处理好医疗损害责任纠纷是一项十分艰巨的任务。司法作为维护公平正义的最后一道防线，在医疗损害纠纷领域必然要起到息纷止争的作用，不仅要平衡医患双方的利益，更要取得促进和谐医患关系之效果。因果关系不仅是医疗损害责任的核心构成要件也是归责的基础。因此，在医疗损害责任纠纷中，因果关系举证责任的分配尤为关键。针对特殊情况下，因果关系难以认定，案件事实真伪不明，传统的民事举证责任分配规则并不能充分发挥，患者因果关系举证责任过重的问题。笔者对我国医疗损害因果关系举证责任分配的现状及存在的问题进行了深入的分析，探讨了两大法系各国家在医疗损害赔偿实践中特殊情形发生时一些切实可行的做法。最后，笔者提出了一点自己观点，即引入因果关系推定理论中的有条件推定说，构建我国的因果关系举证责任缓和规则。只有对医疗损害因果关系的举证责任分配规则做出进一步的完善，方可解决上述问题。