白锈菌是世界广布的被子植物专性寄生病原卵菌,可危害多种野生植物和农林经济作物,最为典型的是寄生在十字花科油料作物,减产率高达到90%-100%,给农业生产造成巨大的经济损失。白锈菌物种的有效识别和鉴定是病害防控的基础,而我国早期对白锈菌的分类鉴定多以形态特征和寄主植物为依据,导致物种的界定极其不清晰,同时物种与寄主之间的关系仍然较为模糊。近年来分子系统学的发展为白锈菌物种的有效识别以及探讨物种与寄主之间关系提供了有效的途径。然而,基于形态特征、寄主范围结合分子系统学对白锈菌的研究确鲜见报道。对新疆的白锈菌进行系统性调查和采集,获得标本130余份,借阅国内馆藏标本以及收集自四川、重庆、山西、云南等地区的白锈菌标本作为参考。基于形态学特征、寄主范围以及分子系统学分析,新疆的白锈菌分布于Albugo、Wilsoninia和Pustula三个属,其中Albugo属含6个种,即:Albugo arenosa、Albugo candida、Albugo ipomoeae-panduratea、Albugo koreana、Albugo lepidii和新种Albugo arabidis;Pustula属5个种,Pustula cancriniae、Pustula helianthicola、Pustula junggarensis、Pustula spinulosa和Pustula xinyuanensis。Wilsoninia含4个种,Wilsoniana amaranthi、Wilsoniana bliti、Wilsoniana portulacae和新种Wilsoniana xinjiangensis;对每个物种的形态学特征进行了详细描述并编制分类检索表。分别重建新疆白锈菌与寄主植物的分子系统发育树,通过协同进化系统分析,白锈菌与寄主间的进化经历了11次协同物种形成事件、1次复制事件、2次复制和跨宿主传播事件、8次丢失事件和11次分支失败事件。其中Albugo属白锈经历了4次协同物种形成事件、1次复制事件、1次复制和跨宿主传播事件、8次丢失事件和10次分支失败事件;Pustula属白锈经历了5次协同物种形成事件、1次复制和跨宿主传播事件;Wilsoniana属白锈经历了3次协同物种形成事件、1次分支失败事件。结果表明在白锈菌各属间存在不同的协同分化事件,协同物种形成、丢失及分化失败三种事件是白锈物种分化的主要途径。