反常散射实验方法研究及蛋白SmIPMI-s结构解析

来源 :中国科学院高能物理研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaochouyu005
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多波长反常散射(MAD)已经成为目前主流的蛋白质结构解析方法。在实际操作中经常用三个甚至更多的波长,为了提高效率,人们尝试着利用两个波长来进行结构解析。以前的研究结果表明remote和inflection波长的组合最接近三个的效果,但是选择inflection波长对光源的稳定性要求很高,这对北京同步辐射(BSRF)这样的第一代光源而言是一个很大的挑战。而peak波长对光源的稳定性要求没有那么严格。本论文通过在BSRF收集的三套数据的分析表明,peak和remote波长的组合经过合适的相位修正以后完全可以达到三个波长的效果。   变性链球菌是龋齿的主要致病菌。本论文对其中的三个蛋白进行了研究,并且解析了其中的异丙基苹果酸异构酶小亚基(SmIPMI-s)的三维结构。它由基因LeuD编码,催化亮氨酸合成过程中的第二步反应,属于顺乌头酸酶超家族。对其结构的解析将有助于更深入的了解它的催化机制和演化过程。另外两个蛋白质已经得到了晶体,正在进行结构的解析。
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