肠道菌群与胆囊胆固醇结石相关性研究

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胆囊结石是常见的外科消化道疾病。胆固醇结石是胆囊结石的主要种类。对于胆囊胆固醇结石成因的理论,大多数学者认为是胆汁中胆固醇过饱和,胆固醇结晶析出引起的。为了进一步探讨其病因,大量研究围绕调控肝脏分泌胆固醇、磷脂和胆汁酸的因素开展。随着研究手段的不断进步,人们发现肠道菌群参与了人类胆固醇的代谢,参与了胆固醇结石核心的形成过程,故肠道菌群在胆囊结石的形成中可能发挥了一定作用。  目的:肠道菌群保持动态平衡状态,对维持人类正常的生理活动起重要作用。肠道细菌数量、比例、定位和生物学特性上的变化,可能造成肠道菌群紊乱。破坏了肠道菌群的动态平衡将影响人体的健康状况,造成不良后果。Illumina MiSeq为二代高通量测序技术,可以快速、准确的研究肠道菌群的丰度、多样性、群落构成。为明确肠道菌群在胆囊胆固醇结石患者中是否存在肠道菌群失调,本实验采用Illumina高通量测序手段分析胆囊胆固醇结石患者与健康人肠道菌群,探究在胆囊胆固醇结石患者与健康人之间是否存在肠道菌群的差异,为探索肠道菌群在胆囊胆固醇结石病因中发挥作用的研究提供一些前期材料。  方法:通过伦理委员会审核后,与样本采集对象签署知情同意书,进而收集2017-05至2018-08就诊于青岛市市立医院符合纳入标准的15名胆囊胆固醇结石患者、15名健康人的粪便样本,将粪便样本保存于-80℃冰箱。统一进行粪便微生物DNA提取,然后对本16SrRNA的V3+V4区进行扩增,应用Illumina MiSeq平台进行高通量测序。测序结果通过Usearch(v.11)软件分析得到OTU序列丰度统计表,从而分析肠道菌群的alpha多样性及丰度。  结果:1.通过对胆囊胆固醇结石患者与健康人各15例粪便样本的DNA提取、检测,扩增30例样本均符合高通量测序标准,共30份样本成功进行高通量测序。  2.胆囊胆固醇结石组共获得69032个有效序列,健康人组共获得60543个有效序列,共计129575个有效序列。正常人组中平均OUT(operational taxonomic units,操作分类单元)(164±24),疾病组中平均OUT(158±19)。  3.通过对两组样本的丰度指标chao1,多样性指标Shannon进行统计学分析,结果P>0.05,无统计学差异。  4.在门水平上两组均检测出14个细菌门。其中厚壁菌门(Firmicutes),拟杆菌门(Bacteroidetes),放线菌门(Actinobacteria),梭杆菌门(Fusobacteria),变形菌门(Proteobacteria),软壁菌门(Tenericutes)占99%以上。  5.细菌属水平上Bacteroides(拟杆菌属)在胆囊结石组与健康人组中均为优势菌属。Ruminococcaceae I.S.在胆囊结石组中的相对丰度高于健康人组(P<0.01)Lachnospiracea I.S.在健康人组中的相对丰度高于胆囊胆固醇结石组(P<0.01);Roseburia(罗氏菌属)在健康人组中的相对丰度高于胆囊结石组(P<0.01);Sporococcus在健康人组中的相对丰度高于胆囊结石组(P<0.01)。  结论:1.应用第二代高通量测序技术Illumina顺利完成了肠道菌群结构分析,揭示了胆囊胆固醇结石患者肠道菌群结构变化;  2.与健康人的肠道菌群相比,胆囊胆固醇结石患者肠道菌群门水平上无明显差异,优势细菌门为厚壁菌门。  3.胆囊胆固醇结石患者肠道菌群在属水平上存在菌群失调。Roseburia、Lachnospiracea I.S.、Sporococcus在胆囊结石患者肠道菌群中减少,Ruminococcaceae I.S.在胆囊结石患者肠道菌群中增多。
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