芥菜（Brassica juncea）是十字花科重要的蔬菜之一,按食用部位可分为叶用、根用、茎用、苔用、籽用等各种类型。叶缘缺刻是叶用蔬菜的重要品质性状。同时缺刻可以影响植物叶片对光的捕获、增强植株对强风的抵抗力、调节叶面温度和控制水分流失等。芥菜叶缘缺刻形成的遗传机理仍未有报道。本研究通过正向遗传学方法,获得了控制芥菜缺刻叶和全缘叶形成的基因Bj RCO2,同时在该位点为纯合缺刻基因型的背景下,鉴定了另一个控制芥菜简单/复杂缺刻的位点。具体结果如下:1)通过BSR-seq方法对3个芥菜F₂分离群体中缺刻叶/全缘叶进行了遗传分析,发现3个分离群体中叶缺刻性状由同一位点控制,该位点位于芥菜10号染色体,将该位点命名为Lobe-leaf1（Ll1）。本研究挑选其中一个分离群体进行缺刻调控基因的精细定位。通过对约4000株植株进行基因分型,将控制芥菜缺刻基因Ll1定位在82kb的区间,该区间共有13个基因,但该区间在芥菜参考基因组中存在两段未测通序列（gap）。在该区间只有碎米芥基因RCO的同源体（Bj RCO2）在两个亲本中存在表达差异。RCO基因是碎米芥叶缺刻的核心调控基因。利用FPNI-PCR等方法在候选区域内成功获得多个串联重复的RCO同源体,同时我们还发现该区域还存在多个串联的LMI1同源体。2)为了获得候选区域的详细序列,本实验中对缺刻叶亲本rt101和全缘叶亲本gre106进行了重测序,利用pair-end方法结合PCR验证,最终在定位区间中鉴定出2个Bj RCO基因和3个Bj LMI1,这5个基因中只有Bj RCO2在双亲中存在核苷酸序列的差异,在上游2kb的区域有29 bp的Indel区别。另外通过q PCR验证了Bj RCO在缺刻叶和全缘叶亲本中的表达量存在显著差异,而Bj LMI1的表达量在两个亲本间没有显著差异。现有的数据表明Bj RCO2在启动子区域29bp的插入使其表达量上升,从而导致芥菜缺刻表型的形成。3)rt101和gre106杂交的分离群体中存在简单缺刻和复杂缺刻的叶型分离,遗传分析共鉴定了六个控制缺刻程度位点,Lobe-leaf 2-7（Ll2-7）。通过传统遗传方法,将控制缺刻程度基因Ll7定位在2号染色体0-3.14Mb之间。本研究鉴定的芥菜缺刻QTL位点,可应用于芥菜的分子育种,并为相关基因的克隆及分子作用机理研究奠定了基础。