基于代谢组学技术的维拉帕米增强MCF-7/ADR细胞对阿霉素敏感性的机制研究

来源 :郑州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:loupee
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究背景:乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,2018年全球癌症统计结果显示,乳腺癌新增约210万例,在所有癌症中排名第二。化疗是临床上治疗乳腺癌的常用手段,但耐药的发生常导致化疗效果不理想。P-糖蛋白(P-glycoprotein,P-gp)是产生耐药的主要原因之一,维拉帕米作为经典的P-gp抑制剂,可通过抑制P-糖蛋白的活性增强化疗药物的疗效,但是维拉帕米逆转乳腺癌化疗耐药的分子机制尚不明确。目的:本文采用代谢组学和生物信息学技术系统分析维拉帕米增强乳腺癌耐药细胞株MCF-7/ADR对阿霉素敏感性的作用及其分子机制。方法:(1)采用MTT实验研究维拉帕米对乳腺癌细胞增殖和耐药性的影响。(2)采用LC-MS/MS分别分析了乳腺癌耐药细胞株MCF-7/ADR和亲本细胞株MCF-7的细胞样本、阿霉素作用于的MCF-7/ADR和MCF-7的细胞样本、阿霉素联合维拉帕米作用于的MCF-7/ADR和MCF-7的细胞样本的内源性小分子代谢物的代谢重编程;通过SIEVE2.2软件对原始数据进行预处理和分析;通过SIMCA14.1软件进行模式判别分析;按照VIP>1和P<0.05的标准筛选差异化合物,并结合Metlin和HMDB等数据库进行差异代谢物确证;使用MetaboAnalyst网站对差异代谢物进行通路分析。(3)通过GEO数据库下载包含乳腺癌耐药细胞株MCF-7/ADR及对应亲本细胞株MCF-7的基因芯片数据的GSE76540数据集;采用经验贝叶斯法筛选MCF-7/ADR和MCF-7细胞之间的差异表达基因;并对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析。结果:(1)MTT实验结果显示:阿霉素作用于MCF-7/ADR和MCF-7细胞48 h后,其对MCF-7/ADR细胞的IC50值为50.87±1.79μM,对MCF-7细胞的IC50值为0.51±0.03 μM,耐药倍数为99.75;8.00μM的维拉帕米作用于MCF-7/ADR和MCF-7细胞48h后,细胞存活率均大于90%,无毒性作用;给药48h后,联合用药组中阿霉素对MCF-7/ADR细胞的IC50值为9.61±0.21 μM,而对照组中阿霉素对MCF-7/ADR细胞的IC50值为50.87±1.79 μM,经计算,维拉帕米对MCF-7/ADR细胞的耐药逆转倍数为5.29。(2)代谢组学研究结果显示:分析MCF-7/ADR和MCF-7细胞株间的代谢轮廓,共筛选出31个差异化合物,包括二氢鞘氨醇、鞘氨醇、鞘磷脂、卵磷脂、胆碱、L-精氨酸、和L-脯氨酸等,主要参与鞘脂代谢、精氨酸和脯氨酸代谢以及甘油磷脂代谢等通路;分析阿霉素作用于MCF-7/ADR细胞后的代谢轮廓,共筛选出17个差异化合物,包括卵磷脂、溶血卵磷脂、鞘磷脂和二氢鞘氨醇等,主要参与鞘脂代谢、甘油磷脂代谢和苯丙氨酸代谢等通路;分析阿霉素作用于MCF-7细胞后的代谢轮廓,共筛选出18个差异化合物,包括鞘氨醇、二氢鞘氨醇、鞘磷脂和L-苯丙氨酸等,主要参与鞘脂代谢和苯丙氨酸代谢等通路;分析阿霉素联合维拉帕米作用于MCF-7/ADR细胞后的代谢轮廓,共筛选出28个差异化合物,包括鞘磷脂、鞘氨醇、二氢鞘氨醇、卵磷脂、胆碱、溶血卵磷脂等,主要参与鞘脂代谢及甘油磷脂代谢等通路;分析阿霉素联合维拉帕米作用于MCF-7细胞后的代谢轮廓,共筛选出26个差异化合物,包括鞘氨醇、二氢鞘氨醇、卵磷脂、亚精胺和L-谷氨酰胺等,主要参与氨酰-tRNA生物合成、精氨酸和脯氨酸代谢、丙氨酸,天冬氨酸和谷氨酸代谢等通路。(3)生物信息学分析结果显示:MCF-7/ADR和MCF-7细胞间共筛选出2898个差异表达基因;GO富集分析结果显示:差异基因的产物主要位于细胞膜和高尔基体等部位,涉及细胞增殖调控等生物学过程;KEGG富集分析结果显示:MCF-7/ADR和MCF-7细胞间的差异基因主要参与鞘脂代谢等通路。结论:(1)MCF-7/ADR细胞的耐药机制可能与鞘脂代谢、甘油磷脂代谢、精氨酸和脯氨酸代谢等通路相关。(2)维拉帕米可能通过上调二氢鞘氨醇、鞘磷脂、卵磷脂、溶血卵磷脂、胆碱等化合物的含量,影响鞘脂代谢和甘油磷脂代谢,影响P-gp的脂质环境,抑制P-gp的转运活性,减少药物的外排,从而增强MCF-7/ADR细胞对阿霉素的敏感性。
其他文献
演讲中,演讲者会注意嗓音的抑扬顿挫、轻重缓急;歌唱时,歌手通过改变自我声调、音强,使嗓音富于变化,悦耳动听;日常生活里,人们会时常留心自我嗓音是否被认为是好听的、舒适
Imatinib 2001年被FDA批准作为慢性粒细胞白血病(CML)患者的主要治疗药物开起了分子靶向治疗的新篇章。然而,随着Imatinib的广泛应用,越来越多的病例出现对Imatinib耐药。尽管
[目 的]探讨线粒体自噬与阻塞性睡眠呼吸暂停综合征(Obstructive sleep apnea syndrome,OS AS)大鼠认知障碍的相关性。[方 法]将36只3月龄SPF级雄性SD大鼠随机分为对照组和实
[目 的]探讨多参数磁共振成像(multiparametric magnetic resonance imaging,mp-MRI)PI-RADS V2评分(前列腺影像数据与报告系统,prostate imaging reporting and data system
急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)是一种短时间内出现肾功能快速减退而导致的临床综合征,它由多种病因引起,其生理表现为肾小球滤过率(GFR)的快速下降,以及氮质废物比如
蒋韵是中国当代文坛山西代表女作家之一,生于50年代的蒋韵自登上文坛起,便始终以一种相对独立的身份默默行走在文坛“边缘”,执着书写自己的精神乌托邦。她以女性特有的清丽
我国城乡结合部地区经济文化发展水平相对落后,存在较多“留守青少年”等问题,同时青少年犯罪问题相对城市中心地区更为常见且复杂。社区矫正作为我国新兴的非监禁式刑罚手段
阳泉煤业(集团)有限责任公司下交煤矿是设计生产能力为0.6Mt/a的资源整合型矿井,可采储量日益减少,矿井服务年限不足5年,而井田内后庄村保护煤柱压煤量为1.17Mt,对矿井生产规模、服务年限和煤炭回采率产生严重影响。因此,下交煤矿村庄保护煤柱的安全开采已成为该矿井目前亟待解决的重大问题。论文采用现场调研、实验测试、理论分析和数值模拟等方法和手段,分析了下交煤矿具体的地质条件、村庄下压煤状况和村庄
目的:分析DYNC1H1基因突变所致下肢明显型脊肌萎缩症(A mutation in DYNC1H1 gene causing spinal muscular atrophy-Lower extremity,dominant,SMALED)患儿的临床特点、诊断
青藏高原东缘作为现今陆-陆碰撞的典型例子,被誉为是打开地球动力学大门的金钥匙,也是目前国际地球科学的研究热点之一。其中尤以“Y”字形构造断裂带(由鲜水河、安宁河和龙门山三大断裂带构成)最为活跃,与三大断裂带相邻的松潘-甘孜地块、川滇地块和扬子块体也因此引人关注。本文通过收集四川台网、云南台网共99个宽频带台站记录到的从2015年1月到2015年12月共一年的背景噪声连续记录,利用互相关叠加等技术得