崇明东滩湿地位于上海崇明岛的东侧,地处长江入海口,是海洋、河流、陆地和岛屿的交汇地带,生物多样性极为复杂。同时,湿地环境作为地球生产力最强的区域,具有快速的营养循环能力,在通过植物光合作用和土壤埋藏固定大量碳的同时,又通过微生物作用释放大量的甲烷等温室效应气体。2000年,大量互花米草入侵了崇明东滩湿地公园,严重损害了原有的生态环境,对生态系统造成了负面影响。植被通过影响湿地土壤的理化性质,如有机碳和氮含量、硫含量、土壤含水率、温度和pH等,来直接影响土壤中微生物的群落结构与多样性;而湿地土壤微生物也会影响土壤的组成结构,从而改变土壤以及周围河流的生态环境。前人研究表明,在不同的植物类型土壤中,微生物群落组成结构差别明显。因此,探究入侵植物与原始植被的根际及非根际土壤的理化参数和微生物群落多样性,对未来开展周围生态环境改善有着重要的指示意义。本研究在崇明岛东滩湿地选取9个站位进行采样,每个站位涵盖3个平行样本,采集根际及非根际土壤共48个样本,对全部样品进行以下指标测定:总有机碳（TOC）和总氮（TN）含量,碳氮稳定同位素(δ13C、δ15N)、粒径、含水量和pH。三种植物各选取一个采样点,进行微生物细菌、真菌测序。所得数据主要从以下三个方面进行分析:1、互花米草、小蓬草和芦苇三种不同植物地下根际土壤及其周围非根际土壤的理化性质之间的差异。2、三种不同植物地下根际土壤及其周围非根际土壤微生物群落结构之间的差异。3、比较三种不同植物的理化性质与微生物群落结构,探究外来入侵植物与原始植被之间的差异性。通过以上三方面的分析,得出以下主要结论:一、互花米草和小蓬草的根际和非根际土壤中的总有机碳、氮含量显著高于芦苇的根际和非根际土壤（TOC:1.41%±0.64%vs.0.242%±0.132%;p＜0.01 TN:0.145%±0.044%vs.0.034%±0.016%;p＜0.001）,但是站位8的芦苇根际和非根际土壤中的氮同位素(δ15N)含量明显高于互花米草和小蓬草的根际及非根际土壤（5.97‰±1.585‰vs.9.49‰±3.44‰;p＜0.05）。站位8相较于其他站位更靠近人类生活区域,可能受到人类活动的影响较大,因此,该站位的氮同位素(δ15N)含量明显高于其他站位。二、互花米草和小蓬草的根际土壤和非根际土壤的氮同位素(δ15N)相近,而芦苇的根际土壤和非根际土壤之间的氮同位素(δ15N)差别较大（0.66±0.2%vs.3.65%±2.32%;P＜0.05）。这说明,对于根际土壤中的微生物群落来说,互花米草根际土壤细菌对土壤中氮同位素的利用更强,而芦苇根际土壤细菌对其周围土壤环境的影响则更弱。三、芦苇和互花米草根际土壤的细菌丰富度大于小蓬草根际土壤（chao指数3335.5vs2634;P＜0.05）。互花米草中的细菌unclassified＿g＿＿Thiobacillus相对丰度较高,这个菌群是硫化细菌的一类,互花米草中可使其所吸附的可溶性s2-在植物内快速氧化为固定的SO42-。这与互花米草根际和非根际土壤中的硫化细菌相对丰度较高有关。四、由于互花米草的入侵而导致土壤pH的下降,大致有以下两方面原因:一是由于互花米草凋落物和根部分泌物中都存在着酸性的化学物质,从而导致了土壤pH值的下降;二是有机质在分解过程中会向土壤溶液中提供更多的质子,而互花米草具有更高的初级生产力,因此,在所测得的9个点位土壤样品的pH中,互花米草所处区域的pH值低于另外两种植物所在区域的土壤pH。土壤pH值变化会影响土壤中的细菌种群构成的同时,土壤pH值的改变还会影响植物根际分泌物。综上所述,土壤pH值和植物之间的相互作用还需进一步研究。