Bordetella sp.BK-52顺式环氧琥珀酸水解酶催化作用的分子机制研究

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:csnd123
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
D(-)-酒石酸主要应用于化工和制药行业,是重要的手性辅助剂、医药拆分剂、手性食品添加剂和手性营养物质添加剂。D(-)-酒石酸的传统生产方法是化学拆分法,近年来,采用经济环保的微生物转化法已逐步成为D(-)-酒石酸生产技术的发展方向,即用含顺式环氧琥珀酸水解酶(cis-epoxysuccinate hydrolase, CESH)的微生物,将顺式环氧琥珀酸转化为D(-)-酒石酸。目前报道的产D(-)-酒石酸的微生物有恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)产碱杆菌(Alcaligenes)和博德特氏菌(Bordetella),其中后两者CESH酶的基因序列已报道。对产D(-)-酒石酸CESH酶的研究迄今仍局限于一级结构层面,目前尚未见从空间结构和反应机理对其进行研究的报道。本研究通过多序列比对、同源建模、分子对接、定点突变、酶学性质研究、电感耦合等离子质谱、同位素标记等方法和手段,首次揭示了博德特氏菌BK-52(Bordetella sp. BK-52) CESH酶的三维结构和催化机制。主要实验结果如下:1、序列比对和二级结构预测分析显示,产D(-)-酒石酸的Bordetella sp. BK-52CESH酶属于未知功能的原核蛋白超家族DUF849成员。2、同源建模显示,该CESH酶具有典型的(β/α)8桶状折叠结构,分子对接结果预测了该酶的活性中心位于β桶中央的C端面。3、金属离子螯合剂测试和电感耦合等离子质谱分析显示,该CESH酶是Zn2+依赖的环氧化物水解酶,并且Zn2+与CESH酶的摩尔比约为1:1。4、27个保守位点的定点突变实验、圆二色谱分析、立体特异性分析和动力学分析证实,下列8个氨基酸在该酶催化过程中起重要作用His47、His49、Arg51、Thr82、Tyrl38、Asn140、 Trp164和Asp251。结合同源建模和分子对接结果,计算了底物与各活性位点以及各活性位点之间的距离。5、CESH酶中的Zn2+起Lweis酸的作用,电感耦合等离子质谱分析显示,His47和His49残基分别充当Zn2+结合位点L1和L2。6、同位素H218O标记的单转化和多转化实验表明,水分子中的18O原子直接转移到产物中,并推测了该酶Zn2+依赖的一步法催化机制。7、该CESH酶与已报道的多数环氧化物水解酶(具有α/β水解酶折叠结构,通过两步法机制反应,并且无需任何辅酶、辅基和金属离子的参与)相比有显著差别,是一种新颖的环氧化物水解酶。
其他文献
探究图书馆创客空间用户的知识分享意愿影响因素,对指导图书馆创客空间建设和提升图书馆服务质量具有重要意义。通过整理40名高校图书馆创客空间用户的访谈资料,依据扎根理论
在低年级仿写教学中,为了避免机械化、克隆化的现象发生,避免对学生思维的限制,教师需要分层指导、适当创新。在仿写的过程中,教师通过梯度式训练,选取与学生生活经验相关的
研究目的:探讨非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC)患者EGFR基因突变与血清C-反应蛋白(C-reactive protein,CRP)水平及临床病理学特征和预后的相关性,分析血清CRP对EGFR基因突变的预测价值。方法:收集2016年1月-2018年10月在岳阳市二人民医院收治并经CT引导下经皮肺穿刺活检术(Percutaneous transthor
作为二语四项基本技能之一,写作最能全面深入地反映学习者的语言水平,因而备受研究者的关注。而写作质量通常通过文本分析来进行考查。回顾二语写作的研究概况不难发现,该领
目的:膀胱肿瘤是世界范围内最常见的肿瘤之一,高达70%的膀胱肿瘤患者最初诊断为非浸润性膀胱肿瘤,其中超过70%的患者可能在未来复发,甚至复发多次。虽然,目前膀胱肿瘤患者的
目的:观察中药保留灌肠中西医结合疗法治疗肝肾综合征的疗效。方法:将56例肝肾综合征患者随机分为两组各28例。两组均予盐酸多巴胺注射液静脉滴注,治疗组加用中药保留灌肠。治疗
针对传统滑模观测器在永磁同步电动机无位置传感器控制过程中出现的抖振问题,本文提出一种改进型滑模观测器。通过采用饱和函数、反电势卡尔曼滤波器来减弱抖振,引入优化的锁
我们主要讨论了非负矩阵、M-阵的Hadamard积与Fan积问题,以及矩阵Hadamard积的一些范数不等式.同时也讨论了逆M-矩阵、零模式不变矩阵、符号模式矩阵、k-幂等阵和符号k-幂等阵
中华民族精神根植于中华各民族的历史演进与文化土壤之中,是民族文化的核心灵魂。中华民族精神在历史传承中不断得到创新和发展。民族精神需要优秀文化的滋养哺育和承载,地域
从20世纪90年代我国提出计算机审计概念开始,计算机辅助审计在我国已经走20多个年头,但由于种种原因,计算机辅助审计在整个行业中的利用仍然处于较低水平。本文通过对我国目