基于染色体置换系的普通野生稻(O.rufipogon Griff.)耐盐性QTL定位

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普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)是栽培稻改良的一级资源库,发掘其在驯化过程中丢失的优异等位基因,将为水稻育种提供重要的基因资源。本研究对普通野生稻和栽培稻(93-11)构建的染色体片段置换系(CSSL)进行耐盐鉴定,利用重测序与分子标记检测进行关联分析,定位耐盐QTL,发掘新的耐盐种质资源。获得以下结果:1.染色体置换系和分子标记筛选:通过对214个野生稻CSSL进行简化基因组测序获得13022个SNP位点,评估CSSL间的差异程度(IBS)。根据CSSL与亲本93-11(0.827886769,该位点对苗期存活率、苗期耐盐等级均具有增效作用,贡献率分别为6.36%、8.13%。在此QTL候选基因内OsDi19-1与非生物胁迫相关。经序列比对发现,OsDi19-1启动子区域在两亲本间存在较大差异,且植物受到盐胁迫时该基因表达量上升。CSSL23、CSSL153在盐处理下其苗期存活率仍能保持在80%以上,存活天数显著高于其他株系。结合耐盐生理数据发现CSSL23、CSSL153通过减少K+流失,增加体内POD、SOD两种过氧化物酶含量,以提高苗期耐盐性。4.全生育期耐盐鉴定及QTL定位:在山东东营盐碱地中对CSSL群体进行全生育期耐盐性检测,根据CSSL群体存活率,定位到5个与全生育期存活率相关位点,分别是qWSR1.1、qWSR2.1、qWSR5.1、qWSR7.1和qWSR10.1。本研究通过对200个染色体置换系不同生育期的耐盐性鉴定,共发掘4个与芽期耐盐相关的QTL,18个与苗期耐盐性相关的QTL,以及5个与全生育期耐盐性相关的QTL,但不同时期耐盐性QTL位点均不相同。同时,鉴定出水稻芽期耐盐的优异种质资源CSSL72、苗期耐盐的优异种质资源CSSL23、CSSL153,为水稻育种中耐盐性的改良提供了新的种质资源。
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