空间诱变水稻Pi-HIT-2基因的结构与表达分析

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本实验通过生物信息学和PCR的方法对水稻Pi-HIT-2基因的序列进行研究,结果表明水稻Pi-HIT-2基因含有2个外显子,972-4和972ck第一外显子序列完全相同,且与预测基本一致.第二外显子可能存在两种不同的转录后加工方式.根据Pi-HIT-2基因全长cDNA序列得到其氨基酸序列,NCBI BlastP结果显示该基因氨基酸序列与水稻细胞白介素(BAD53999)高度同源.本实验克隆并测序了Pi-HIT-2基因5侧翼序列,通过Transfac和PLACE检索到一些重要的抗逆相关的顺式作用元件.本文对水稻基因Pi-HIT-2的表达模式进行初步的研究.用Northern Blot方法在转录水平上研究Pi-HIT-2基因的组织特异性表达特点,结果表明,水稻Pi-HIT-2基因在所检测的叶鞘和叶片中有表达,而在根中没有检测到Pi-HIT-2基因的表达.在研究水稻基因Pi-HIT-2在各种外界环境压力下的表达情况时发现,972ck品系中Pi-HIT-2基因在稻瘟病诱导和盐胁迫下表达没有明显变化,而972-4品系中Pi-HIT-2基因在稻瘟病诱导和盐胁迫下表达量明显增加.在两种品系中Pi-HIT-2基因在低温胁迫和高温胁迫下表达量都明显下降.这些实验结果揭示水稻Pi-HIT-2基因可能与抗逆性密切相关.
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