随着全球经济一体化趋势的加快,各个领域的竞争也越来越激烈。如何适应各个领域越来越激烈的竞争,如何适应瞬息万变的市场需求,不仅是企业的事情,也是高等学校的当务之急。知识经济时代的来临促使高等学校的科研管理工作必须在反应速度上更加敏捷,更加富有成效。随着科学技术的不断发展,科学研究活动已成为一种专门的社会职业,成为整个社会的重要的组成部分。科学发展趋于整体化,越来越强调学科间的交叉和综合,在研究方式上表现为集体协作的特点,从而使得科研管理的重要性愈显突出。现有的高校科研管理工作流程缺乏项目信息传递和项目申报的组织工作,更重要的是要缺少对于项目的进度、经费使用、完成质量的检查、监督和监管工作。为了符合组织的现实情况,为了规避风险,提出了将业务流程改进BPI与重组BPR技术进行揉合的思想,用于高校科研流程的重组,重点在于加强科研管理中信息沟通、项目策划、项目监管比较缺乏的现状。论文通过将BPR理论和高校科研管理工作的实际相结合,运用了ESCRI方法,同时总结科研管理实践,与一线的工作者进行研讨,吸收成功高校的经验,对科研管理工作流程进行优化设计,强化了沟通和监管职能,从而为高校科研管理工作在管理思路和方法上做出有益的尝试。通过研究,提出经过优化的高校科研管理方法,并依据改进后的工作流程,对高校科研管理系统进行了试验性的设计。