可持续发展是面向二十一世纪的全球发展战略,环境问题已成为西方国家制约我国经济持续发展的瓶颈之一,节能减排环境保护工作是我国目前面临的重要课题。政府投入巨大的公共资金,建成了众多节能减排重点工程项目。为了鉴证、监督以及评价其运行的效果,节能减排项目绩效审计随之被提上了日程,并且成为目前审计领域的新热点。审计实践的发展需要理论研究的支撑,与节能减排项目绩效审计的实践不相符的是,理论界对此研究甚少。从已有的一些研究来看：对这些公共投资下建成的节能减排项目所开展的审计大多停留在真实性和合法性为重点的财政财务收支审计,还没有全面提升到绩效审计的层面；此外,亦未建立统一规范的绩效审计评价指标体系。因此,深入研究节能减排项目的绩效审计,构建相应的评价指标体系,既可以弥补以往理论研究的不足,又可以为政府相关部门审计节能减排项目是否达到设计的功能目标提供可靠的科学依据。本文根据公共投资下建成的节能减排项目的特点探究如何对其开展绩效审计,搭建了一个节能减排项目绩效审计的理论框架；并重点研究了节能减排项目绩效审计的评价指标与审计报告,因为科学合理的评价指标与最终的结论及建议是节能减排项目绩效审计发挥作用最重要的两个环节。具体研究思路如下：首先,本文综述国内外学者的相关研究,以此为基础开展理论分析。本文引入外部效应理论、公共产品理论和受托责任理论作为理论支持,通过分析公共投资下建成的节能减排项目的特性,实现了对节能减排项目绩效审计的准确定位,进而提出了开展节能减排项目绩效审计的理论框架。其次,本文以节能减排项目绩效审计的理论框架为基础,根据国际上公认的绩效审计3E评价标准分别从经济性、效率性和效果性三个方面构建了节能减排项目的绩效审计评价指标体系,并对绩效审计的最终环节——绩效审计报告深入剖析。最后,本文采用案例分析法,运用本文所形成的节能减排项目绩效审计理论成果对中科成污水处理项目开展绩效审计分析,以验证理论研究,达到理论指导实践的效果。本文选取从绩效审计的角度切入讨论公共投资下的节能减排项目的审计问题,并将国际上公认的绩效审计“3E”评价标准引入节能减排项目绩效审计的评价指标体系架构中,由此构建了一套专门针对节能减排项目的绩效审计评价指标体系。本文实现了研究角度的创新,并为填补当前节能减排项目绩效审计评价指标体系不足的缺陷做出了努力,希望能够对我国的节能减排项目绩效审计工作略尽绵薄之力。