高校管理活动的自主性、复杂性、权利义务关系的多样性，给高校管理带来了许多新的问题和挑战，完善学校内部治理结构是解决这些困难的重要工作。高校财务治理作为高校治理环节和结构中不可缺少的一环，对高校教学、科研及其他工作的开展有着直接影响，在高校的组织机构治理中起着支撑、衔接各项工作的重要作用。在市场经济的大环境下，为规范高校财务行为，强化财务管理，提高教育经费使用效益，进一步推进高等学校内部管理体制改革，按照现代大学制度要求建立高等学校法人治理结构，完善高校财务治理体系已越来越受到政府、社会和高校自身的重视。本论文通过界定与公办高校财务治理有关的理论、概念和范畴，以此分析和建立公办高校财务治理的各个要素，结合高校实际情况和已有的高校财务治理评价指标，设计和完善了一套适合于我国公办高校财务治理的评价体系，用基于指数标度的层次分析法确定了主要评价指标的权重值并划分了评价等级，为高校财务治理的科学评价提供了更好的理论依据。该论文的研究结果对于我国公办高校内部治理以及现代大学制度建设将产生重要影响。优化、合理的财权配置可以促使高校财务科学决策和财务有效监督，提高治理效率，从而规范校内经济秩序，提高教育投资效益，确保高校健康可持续发展。