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目的:目前甲状腺癌（Thyroid carcinomas TC）是上升最快的实体肿瘤,本研究通过免疫组化方法（Immunohistochemistry IHC）检测甲状腺癌中增殖指数（Ki67）和BRAF（鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌同源体B1）蛋白的表达,探讨两者表达与甲状腺癌临床病理特点的关系进而为甲状腺癌的诊断提供依据。方法:（1）收集新疆维吾尔自治区人民医院2013年1月-2015年6月间经组织学及免疫组化诊断并随后经两名高年资医师复查确诊为甲状腺癌及癌旁正常甲状腺组织病例共计130例,以上病例均为石蜡包埋组织,全部患者术前均未行辅助化疗、内分泌治疗或放疗,运用SPSS17.0统计软件进行统计学分析各蛋白在甲状腺癌以及癌旁正常甲状腺组织中的表达关系及其临床病理学意义。结果:（1）110例甲状腺癌Ki67、BRAF的阳性表达率分别为39.1%和56.4%;以甲状腺乳头状癌（Papillary thyroid carcinoma,PTC）和甲状腺未分化癌（Anaplastic thyroid carcinoma ATC）的表达最高,20例癌旁正常组织中Ki67、BRAF蛋白的表达均为阴性。（2）BRAF在甲状腺癌中的表达率为73.75%,但在甲状腺微小乳头状癌（Papillary Thyroid microcarcinoma PTMC）中的表达较甲状腺乳头状癌低,另外在包膜侵犯、淋巴结转移、TNM分期上差异均有明显的统计学意义（P<0.05）。（3）多灶性甲状腺乳头状癌42例,占52.5%,其中BRAF的表达仅与淋巴结转移有明显的统计学差异,而Ki67的表达与多灶性甲状腺乳头状癌的相关不良预后因素均有统计学意义,其中一例中出现了Ki67、BRAF表达不一致的情况。（4）甲状腺乳头癌中BRAFV600E蛋白的表达与Ki67具有明显的正性相关（r=0.234,P<0.05）。结论:BRAF、Ki67蛋白对鉴别甲状腺组织的良恶性有价值;Ki67对甲状腺癌的恶性程度的判定上有参考意义;Ki67、BRAF蛋白的高表达可为甲状腺乳头状癌的鉴别诊断以及预后判断提供参考资料。