生态补偿作为社会经济发展和生态环境保护之间的纽带,其补偿机制的建立已经成为研究热点问题。本文基于重庆三峡库区后续发展,首先,以三峡库区上下游政府间关系为导线,根据“谁保护谁受益,谁破坏谁补偿,谁享受谁补偿”的原则,并引入“奖惩约束”因子,建立了重庆三峡库区后续发展生态补偿博弈论模型,研究库区后续发展生态补偿模式;其次,引入了“生态补偿强度”的概念,并建立函数关系,与机会成本法结合用于测算三峡库区的生态补偿额度,采用系统动力学方法,将库区生态补偿分为三个子系统:社会子系统、环境子系统和经济子系统,构建重庆三峡库区后续发展生态补偿系统动力学模型,在模型检验通过的基础上,调整模型的参数,设置不同方案并预测其未来发展趋势;最后,通过分析对比各方案未来变化趋势,研究库区后续发展生态补偿机制。主要研究结果如下:(1)基于重庆三峡库区上下游政府之间的关系构建了生态补偿博弈模型,并研究模型的演化稳定策略,利用雅克比矩阵局部均衡点的方法分析博弈模型的稳定状态,得到保护-补偿策略是该博弈模型的最优解,则重庆三峡库区后续发展生态补偿的最优模式为上游保护,下游补偿。(2)基于重庆三峡库区生态补偿影响因子的因果反馈关系,建立了库区社会-环境-经济的系统动力学模型,运用历史检验的方法证明模型是有效的。通过调整系统动力学模型的参数,设计了自然发展型、环境保护型、经济发展型和技术创新型四个方案,动态模拟预测了不同方案对社会-环境-经济系统的影响,模拟结果表明:自然发展的状态下,GDP的快速增长会造成环境污染总量的增加;环境保护型表现为生态环境的污染得到了一定的控制;经济发展型表现为经济的快速发展,但是破坏了三峡库区的生态环境;技术创新型表明技术的创新可以明显的提高GDP的增长速度,且会使库区的生态补偿额度增加。(3)通过对比各方案的GDP、环境污染总量和生态补偿额度模拟结果,分析结果表明:增加环保投资额会促进库区生态补偿额度的增加,并且对库区的污染治理起到了促进作用;而经济发展型和技术创新型的补偿额度会在未来超过环境保护型,其中,经济发展型的生态补偿额度最高,但是会严重破坏库区的生态环境。针对以上研究结果,对重庆三峡库区生态补偿机制的建立提供了政策建议。