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本文介绍了生物信息学的产生背景，定义；目前研究的主要内容、价值、意义及其社会影响；国内外研究的现状，面临的机遇与挑战；研究所需要的理论与实践基础。
本文先介绍基因调控网络到基因模块调控网络，进而引出基因模块概念，然后介绍目前计算发现基因模块的方法。Segal等人提出的GeneXpress的方法，其中核心的算法是EM算法，Bar-Jaseph等人提出的GRAM[2](geneticregulatorymodules)算法，Barkai等人提出的Signature迭代算法。简单提出几个可以做或者改进的地方。