【摘 要】
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目的:探究肌层浸润性膀胱癌可能的预后相关蛋白质,并试图根据这些蛋白质预测肌层浸润性膀胱癌的预后,并建立风险评分模型。方法:从肿瘤蛋白质图谱（The Cancer Proteome Atlas,TCPA）和肿瘤基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）中下载相关蛋白质谱、基因表达数据以及相应的临床特征数据。在生物信息学的帮助下,采用Kaplan-Meier（KM）法和单因
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目的:探究肌层浸润性膀胱癌可能的预后相关蛋白质,并试图根据这些蛋白质预测肌层浸润性膀胱癌的预后,并建立风险评分模型。方法:从肿瘤蛋白质图谱（The Cancer Proteome Atlas,TCPA）和肿瘤基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）中下载相关蛋白质谱、基因表达数据以及相应的临床特征数据。在生物信息学的帮助下,采用Kaplan-Meier（KM）法和单因素COX回归分析,筛选出与肌层浸润性膀胱癌（MIBC,muscle-invasive bladder carcinoma）患者的预后生存相关的蛋白。然后,对这些预后生存相关的蛋白进行多因素的COX回归分析,最终获得了与预后相关的关键蛋白。我们探讨了这些肌层浸润性膀胱癌预后相关的关键蛋白的潜在分子机制和性质,建立了肌层浸润性膀胱癌预后相关蛋白风险评分模型,并对模型进行验证。通过绘制桑基图来表示获得预后蛋白质与共表达蛋白的相关性,并将6个预后相关蛋白导入Cytoscape绘制了预后相关的关键蛋白的蛋白互作网络（PPI,protein protein interaction network）。此外,我们将这些关键蛋白转化为相对应的基因,并对这些基因的改变进行了探究。最后,在肿瘤免疫数据库（TIMER）中分析了相应基因与免疫浸润之间的关系。结果:总共获得6个蛋白被确定与MIBC的预后显著相关,并基于这些蛋白质（BECLIN、EGFR、SRC、ANNEXIN1、AXL和RICTOR）构建肌层浸润性膀胱癌的预后风险评分模型。在膀胱癌细胞中这些蛋白的基因均有不同程度的改变,并且ANXA1、AXL、EGFR与CD8+T细胞呈正相关。结论:我们获得了6种与肌层浸润性膀胱癌预后相关的蛋白质,并以此构建肌层浸润性膀胱癌的预后蛋白风险评分模型。这6个预后相关蛋白的异常表达可能是由相应的基因改变引起的。此外,这些基因可能是通过免疫细胞浸润来影响患者的生存率。
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