近年来集装箱多式联运正日益成为国际物流活动的主导运输组织形式，其功能和效益将在更深程度上得到发挥和体现。我国和美国集装箱运输起步的时间大致相同，经过几十年的发展，美国的集装箱运输已经进入到综合物流时期，而我国却仍很落后。深入细致地研究我国集装箱多式联运系统的优化，很有必要。 本论文运用系统分析方法、模糊数学、运输化理论和耗散结构理论，做了以下四个方面的工作： (1) 进行集装箱多式联运系统的要素分析；在此基础上，提出集装箱多式联运系统的第二结构模式；利用第二结构模式，作出集装箱多式联运系统的优化动态图。 (2) 根据优化动态图分析集装箱多式联运系统动态评价的结构，对集装箱多式联运系统的三级模糊综合评判进行形式演算。 (3) 根据运输化理论，说明在可预见的未来，我国的集装箱运量在其上升的过程中，必到达一个极大值，即存在可预见的集装箱最大运量；在此基础上提出集装箱多式联运系统的可预见最优结构的概念，并提出阶段最优结构应适度超前并逼近可预见最优结构的思想。 (4) 集装箱多式联运企业是集装箱多式联运系统能力效益的实现者，从这个基本事实出发，分析集装箱多式联运的综合成本、服务质量与集装箱多式联运系统发展的关系；说明相关的法律法规的建设与执行监督机制是系统远离平衡的条件，降低综合成本和提高服务质量到达一定阈值时，将导致集装箱多式联运系统的良性自组织。 论文的研究为集装箱多式联运系统的优化构建合理而简洁的逻辑框架做了一点工作，对进一步研究我国集装箱多式联运系统的动态优化有一定的参考意义。