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黄萎病是棉花主要病害,严重威胁棉花生产,为了研究棉花抗黄萎病遗传机制,培育抗性优良的棉花新品种,本研究针对已拥有的棉花种质材料开展了农艺形状、分子标记及抗病性的遗传多样性分析,采用Griffing法探讨了棉花抗黄萎病的配合力和遗传力的特性,利用构建的抗、感基因池对F2群体进行抗性遗传连锁分析及利用自然群体进行了关联分析,研究得出以下结论:1.通过农艺性状的聚类分析,将200份材料(系)聚为3大类。根据聚类结果表明新疆棉区抗、耐黄萎病材料较少,抗、耐材料大多数为中棉所引进材料。